280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2365 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2365  hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 266 aa  547  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  64.03 
 
 		 260 aa  341  7e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  45.85 
 
 		 263 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  44.14 
 
 		 267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  46.69 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  42.02 
 
 		 264 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  43.48 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  44.66 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  44.66 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  43.68 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  43.98 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  43.48 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  43.8 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  41.9 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  44.27 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  46.64 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  46.64 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  46.64 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4202  hydroxypyruvate isomerase  47.67 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4572  hydroxypyruvate isomerase  47.67 
 
 		 258 aa  221  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  42.25 
 
 		 258 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  42.25 
 
 		 258 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  44.66 
 
 		 269 aa  221  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  44.57 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  43.61 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  43.61 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  43.61 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  43.97 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  41.86 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  44.27 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  43.19 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  41.86 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  43.23 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  43.23 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0609  hydroxypyruvate isomerase  43.02 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  44.44 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  43.02 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  42.86 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  43.41 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  43.92 
 
 		 268 aa  216  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  42.64 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  42.64 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  42.64 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1133  hydroxypyruvate isomerase  46.51 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.926547  normal  0.304342 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00458  hydroxypyruvate isomerase  42.64 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3104  hydroxypyruvate isomerase  42.64 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00463  hypothetical protein  42.64 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  46.12 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  42.21 
 
 		 269 aa  214  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  42.21 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  43.08 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  42.13 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  39.77 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  40.08 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  43.68 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  45.56 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  42.69 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  45.06 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2268  Hydroxypyruvate isomerase  43.97 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  41.09 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  41.09 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  39.3 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  42.69 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  40.38 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  40.77 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  42.8 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  42.69 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  39.3 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  40.38 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  42.29 
 
 		 261 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  42.41 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  42.52 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1026  hydroxypyruvate isomerase  43.19 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  42.8 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  40.78 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1953  Hydroxypyruvate isomerase  42.86 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.346217  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  42.02 
 
 		 262 aa  201  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  40 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  42.8 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  40.7 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  40 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  42.29 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  42.8 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  40.31 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  42.8 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.79 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  40.86 
 
 		 262 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  40.32 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4320  hydroxypyruvate isomerase  40.31 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1855  hydroxypyruvate isomerase  41.38 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  38.65 
 
 		 262 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  38.17 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2745  AP endonuclease  40 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978898  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2823  hydroxypyruvate isomerase  40 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1461  AP endonuclease  40 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331039  normal  0.325369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  41.13 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3036  hypothetical protein  39.92 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  41.46 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02589  hypothetical protein  39.92 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  39.92 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>