155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0036 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.22 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  29.86 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  30.63 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  30.7 
 
 		 253 aa  99.4  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  31.6 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  32.37 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.06 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  29.09 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  29.09 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  28.36 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  28.85 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  28.85 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  32.08 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.37 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  28.04 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  28.99 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  30.69 
 
 		 254 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  27.91 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.88 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.23 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.78 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  26.5 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  28.79 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.49 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  25.37 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  28.65 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  27.19 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  25.86 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.42 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  28.7 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  27.64 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  25.77 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.68 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  23.32 
 
 		 308 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  26.44 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  24 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  25.76 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  26.47 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.79 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  26.34 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  26.06 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  25.87 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.75 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24530  sugar phosphate isomerase/epimerase  22.62 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  23.35 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  28.93 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.27 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6143  xylose isomerase domain-containing protein  23.37 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.536999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  25.83 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  28.09 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  25.41 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  25.38 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  24.26 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1537  xylose isomerase domain-containing protein  27.95 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36398  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  27.22 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  22.99 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  21.01 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  25.45 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  27.43 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  27.41 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  27.14 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  26.98 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  22.44 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.26 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  25.95 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  26.01 
 
 		 287 aa  52.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  24.81 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  30.08 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  25.22 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  23.25 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  27.71 
 
 		 304 aa  52  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.89 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  22.03 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  21.9 
 
 		 323 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  21.93 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  25.15 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0325  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.45 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  23.25 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  26.84 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  22.85 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  26.17 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1640  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.04 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  24.1 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3766  xylose isomerase domain-containing protein  25.79 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50217  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.99 
 
 		 287 aa  48.9  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  23.37 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  23.94 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.77 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  23.47 
 
 		 749 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  25.2 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  23.55 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  24.61 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  24.89 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1928  hypothetical protein  26.04 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  25.55 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>