21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1537 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1537  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 265 aa  547  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36398  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  27.37 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  24.76 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.95 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  25.11 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  26.47 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  33.63 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  25.24 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  26.41 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  24.68 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  25.6 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  29.59 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  26.41 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  33.1 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.15 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  23.39 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  26.41 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  23.83 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  25.93 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.7 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.08 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>