42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3105 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 257 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.67 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.71 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  47.22 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  41.09 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  34.57 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.78 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  33.19 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.78 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.78 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  34.07 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  32.47 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  30.61 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.52 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.49 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  28.84 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.96 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  23.89 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  25.22 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.83 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.05 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  25.35 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  27.45 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  23.58 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  24.74 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  23.08 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  22.22 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.75 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  23.68 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  22.22 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  25.53 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  25.28 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.06 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1537  xylose isomerase domain-containing protein  27.15 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36398  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  26.18 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  29.9 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  31.47 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  19.81 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  32.29 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  37.66 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  30.93 
 
 		 237 aa  42  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>