56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1974 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 256 aa  529  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  64.68 
 
 		 257 aa  358  4e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  61.11 
 
 		 257 aa  328  6e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  55.16 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  49.21 
 
 		 256 aa  269  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  40.73 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  36.33 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  32.43 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.5 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  32.48 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  27.8 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  29.58 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  29.58 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  31.84 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  29.17 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  33.84 
 
 		 237 aa  95.9  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  32.46 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  24.23 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  33.77 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  30.71 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.99 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  32.83 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  25.3 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.76 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.27 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  30.61 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  31.31 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  28.63 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.89 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  29.73 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  25.24 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  25.12 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  27.54 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.33 
 
 		 325 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  27.8 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  25.52 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  28.24 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  31.98 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.22 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  22.62 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  23.56 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  27.21 
 
 		 287 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.91 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.87 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  24.77 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  32.22 
 
 		 281 aa  45.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.06 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  27.62 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  27.36 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  27.78 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.72 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  26.77 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.62 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.19 
 
 		 282 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>