58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0871 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  494  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  57.26 
 
 		 243 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.89 
 
 		 243 aa  267  8.999999999999999e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  53.45 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  46.55 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  35.17 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  34.03 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  36.92 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  37.26 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  30.64 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.74 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  28.23 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  31.79 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  31 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  31.78 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  27.73 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  30.51 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  30.13 
 
 		 253 aa  89  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  29.44 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  30.93 
 
 		 268 aa  88.6  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  31.64 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  30.93 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  30.21 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  27.5 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  29.25 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.92 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.43 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  30.86 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.93 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  30.32 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  29.36 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  30.43 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  28.04 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  29.47 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.12 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  30.89 
 
 		 255 aa  52  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  28.49 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  25.93 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  30.63 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  30.23 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  28.29 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  25.37 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.87 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  29.27 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  25.97 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  24.75 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  26.56 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.47 
 
 		 325 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  26.95 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.52 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.18 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  26.64 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  26.64 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  26.64 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  31.25 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.14 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>