83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0655 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  100 
 
 		 278 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.96 
 
 		 282 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  54.65 
 
 		 262 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.09 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.26 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.92 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.92 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  33.2 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  30.49 
 
 		 255 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  29.43 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.54 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  34.34 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  29.69 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  28.79 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  26.36 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.05 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  27.32 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  26.77 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  25.91 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.19 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  26.57 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  28.64 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  27.93 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  25.23 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.5 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.31 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  27.14 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.88 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  28.04 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  25 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  23 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.61 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  32.32 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  29 
 
 		 244 aa  52.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.31 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  25.97 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.83 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.44 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  23.92 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.03 
 
 		 258 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  30.19 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1928  hypothetical protein  24.49 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  33.95 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  31.25 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  26.11 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  31.11 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  29.88 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.77 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  25.58 
 
 		 243 aa  45.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.26 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.246653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.64 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  29.11 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  28.37 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  29.11 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  24.09 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  26.62 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.11 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  29.11 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  29.11 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  29.11 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  29.11 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  28.14 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.32 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  30.46 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  27.5 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  24.69 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  30.46 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  29.31 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  30.46 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  30.46 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  31.25 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  27.74 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  30.91 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  30.91 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  27.63 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  31.76 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  28.28 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  30.46 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  27.08 
 
 		 286 aa  42  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  30.3 
 
 		 285 aa  42  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  30.3 
 
 		 285 aa  42  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>