29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1928 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1928  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  510  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  30.6 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  29.05 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.85 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  26.29 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.49 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  27 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  24.62 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.7 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  23.37 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  27.53 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.02 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  23.19 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  26.02 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.32 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.18 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  29.5 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  25.77 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.04 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  24.49 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  26.92 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  29.27 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  24.84 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  24.12 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  25.31 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  24.2 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.71 
 
 		 258 aa  42  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>