31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1494 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  65.8 
 
 		 269 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  63.94 
 
 		 269 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  65.43 
 
 		 269 aa  352  5e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  32.84 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  32.47 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  32.23 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  28.36 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.91 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  27.49 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  27.19 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.7 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  31.31 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  26.98 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  26.98 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  26.59 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  25.58 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  26.04 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  26.29 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  26.46 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1928  hypothetical protein  29.5 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.33 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  23.56 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  24.26 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  25.24 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.61 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.62 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  23.56 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.61 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.02 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.58 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>