59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1592 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  62.65 
 
 		 257 aa  343  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  58.04 
 
 		 256 aa  325  6e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.11 
 
 		 256 aa  315  5e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  47.62 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  40.56 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  39.44 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  39.13 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  32.92 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  33.05 
 
 		 268 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  32.22 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  32.52 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  31.8 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.6 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  26.85 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.57 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  33.17 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  31.56 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  29.44 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  32.18 
 
 		 237 aa  86.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  31.16 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  29.02 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.56 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.22 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  29.88 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.09 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  30.58 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  30.04 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  28.64 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  27.93 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.05 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  26.71 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  29.33 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  30.53 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  31.69 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  25.88 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  25.58 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  27.8 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.22 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  30 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  31.01 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  21.62 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  25.6 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.78 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  28.36 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  22.35 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.53 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.23 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.02 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1550  AP endonuclease  24.68 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  23.53 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  21.28 
 
 		 304 aa  45.4  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  24.57 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.09 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  23.58 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.83 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  40.74 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>