64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1398 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 
271 aa  554  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  33.77 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  28.79 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.83 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  32.09 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  32.52 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  31.96 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.91 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  32.39 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  29.77 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  29.63 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  30.58 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  30.15 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  28.43 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  27.62 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  29.44 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  30.58 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  29.25 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  22.93 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.57 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  29.13 
 
 
268 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  29.33 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  32.74 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  37.63 
 
 
255 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  29.13 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.15 
 
 
243 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.99 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  29.25 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.53 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  29.76 
 
 
268 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  35.09 
 
 
253 aa  58.9  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  28.43 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.88 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  29.44 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  30.32 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  28.11 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.94 
 
 
256 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.52 
 
 
258 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.32 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.52 
 
 
258 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  27.23 
 
 
257 aa  52  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  27.2 
 
 
304 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.95 
 
 
256 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  29.81 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.93 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  30.82 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  25.25 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  24.87 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  26.36 
 
 
274 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  26.05 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  26.18 
 
 
316 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  26.25 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.94 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  27.49 
 
 
256 aa  45.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  23.56 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3766  xylose isomerase domain-containing protein  27.64 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50217  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  31.91 
 
 
304 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  27.56 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.51 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  30.34 
 
 
278 aa  43.5  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5503  hypothetical protein  25.57 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.31 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.55 
 
 
278 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>