99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0122 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  31.25 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  33.49 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.49 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  29.44 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  31.16 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  30.86 
 
 		 264 aa  111  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  27.47 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  33.98 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  33.09 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  30.64 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  33.21 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  30.6 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  32.67 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  26.54 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  25.98 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  26.85 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  25.33 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  32.72 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  31.07 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  27.83 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.27 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.69 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  29.26 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  26.07 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  29.41 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.45 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  25.5 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  24.28 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.53 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  29.09 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.6 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  24.14 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  25.3 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1537  xylose isomerase domain-containing protein  27.37 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.99 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  22.93 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  26.34 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  24.62 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  22.48 
 
 		 287 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  26.67 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  20.9 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  29.73 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.39 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  28.48 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  23 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  24.87 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  24.31 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.58 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.75 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  26.63 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  27.22 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  21 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  27.22 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  27.22 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6143  xylose isomerase domain-containing protein  20.11 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.536999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  26.63 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  25.7 
 
 		 296 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  25.7 
 
 		 296 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  18.18 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.13 
 
 		 312 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.5 
 
 		 282 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  25.84 
 
 		 296 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  20.21 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  22.7 
 
 		 325 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1550  AP endonuclease  27.22 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  19.87 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  24.16 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  21.79 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.75 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  27.36 
 
 		 748 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  28.42 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  27.54 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.98 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  23.11 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3304  xylose isomerase domain-containing protein  19.4 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  28.48 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  18.35 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  18.46 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  22.75 
 
 		 292 aa  46.2  0.0005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  22.27 
 
 		 304 aa  45.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  20.44 
 
 		 294 aa  45.4  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.13 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  18.91 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1499  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.07 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  27.39 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.29 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  27.17 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1078  xylose isomerase domain-containing protein  21.17 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  23.13 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.93 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1123  xylose isomerase domain-containing protein  24.88 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.97 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  18.99 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  20.38 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  26.75 
 
 		 298 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>