14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1123 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1123  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  554  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1076  hypothetical protein  53.73 
 
 		 280 aa  300  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.17 
 
 		 267 aa  298  6e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1270  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.26 
 
 		 268 aa  293  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1134  hypothetical protein  53.88 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.61666  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1499  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.5 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1072  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.29 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1679  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.95 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.917084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2597  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3496  hypothetical protein  27.17 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1367  hypothetical protein  25.1 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0856  hypothetical protein  27.06 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1756  hypothetical protein  23.08 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  24.88 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>