17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1262 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 267 aa  543  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1499  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  66.67 
 
 		 272 aa  371  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1270  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.98 
 
 		 268 aa  340  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1076  hypothetical protein  59.85 
 
 		 280 aa  331  9e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1072  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.24 
 
 		 264 aa  318  6e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1123  xylose isomerase domain-containing protein  54.17 
 
 		 269 aa  298  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449759  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1134  hypothetical protein  55.43 
 
 		 268 aa  294  9e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.61666  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2597  xylose isomerase domain-containing protein  25.59 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1679  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.77 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.917084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0856  hypothetical protein  27.6 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3496  hypothetical protein  25.19 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1367  hypothetical protein  26.17 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0343  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.017583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3122  hypothetical protein  28.06 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  27.13 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2481  hypothetical protein  23.38 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1756  hypothetical protein  20.48 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>