38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1078 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1078  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  564  1e-160  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3403  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.35 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  27.44 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  22.97 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  26.43 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  24.62 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  24.07 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3304  xylose isomerase domain-containing protein  24.23 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  24.32 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  25.62 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  22.32 
 
 		 277 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.56 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  23.61 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  25.73 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  26.11 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.32 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.38 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  25.88 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.88 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  20.49 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  26.09 
 
 		 326 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  23.11 
 
 		 269 aa  45.4  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  22.7 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  24.31 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  22.28 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  22.22 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  25.78 
 
 		 354 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  24.39 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  24.1 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  23.21 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.35 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.34 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  24.5 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  25.15 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1969  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.24 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0140  xylose isomerase domain-containing protein  25.78 
 
 		 248 aa  42.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0138  xylose isomerase domain-containing protein  25.78 
 
 		 248 aa  42.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  25.11 
 
 		 241 aa  42.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>