84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0272 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 308 aa  625  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  35.78 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  41.38 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  35.6 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  35.03 
 
 		 709 aa  206  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  30.04 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  29.17 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19520  xylose isomerase  28.37 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0708  xylose isomerase domain-containing protein  27.9 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00278763  hitchhiker  0.000000000165231 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  27.54 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22690  xylose isomerase  26.21 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0353  Xylose isomerase  23.81 
 
 		 383 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0150  xylose isomerase  25.94 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0857233 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5559  xylose isomerase  23.77 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.324328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2430  xylose isomerase  25.69 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404245  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  25.69 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01690  xylose isomerase  24.23 
 
 		 397 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0704  xylose isomerase  24.77 
 
 		 386 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1696  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.1 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5294  xylose isomerase  21.74 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1795  xylose isomerase  23.88 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000406384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3307  xylose isomerase  26.61 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0151761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6687  xylose isomerase  24.51 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0181  xylose isomerase  27.98 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  22.01 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  24.5 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1603  xylose isomerase  24.38 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2375  xylose isomerase  25.24 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0903  xylose isomerase  26.05 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.122683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0645  xylose isomerase  23.55 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12173  normal  0.0105473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2884  xylose isomerase  24.23 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4665  xylose isomerase  25.84 
 
 		 405 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.025606  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2985  xylose isomerase  24.15 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0777216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.23 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  24 
 
 		 393 aa  65.9  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3973  xylose isomerase  24 
 
 		 395 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  24.89 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  27.12 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2064  xylose isomerase  25.6 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0692  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.07 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.822847  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2827  xylose isomerase  23.87 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0987  xylose isomerase  25.13 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2618  xylose isomerase  23.23 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3254  xylose isomerase  22.76 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0695  xylose isomerase  23.01 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1247  xylose isomerase  22.12 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2692  xylose isomerase  22.96 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0222  L-rhamnose catabolism isomerase  28.48 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.43 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4611  xylose isomerase domain-containing protein  25.71 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  25.15 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.4 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1262  xylose isomerase  22.39 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2213  L-rhamnose catabolism isomerase  21.43 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.118721 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  24.34 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1762  xylose isomerase  22.22 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4214  xylose isomerase domain-containing protein  26.09 
 
 		 424 aa  55.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0943011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.81 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5806  L-rhamnose catabolism isomerase  24.17 
 
 		 430 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6706  L-rhamnose catabolism isomerase  24.29 
 
 		 430 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6263  L-rhamnose catabolism isomerase  24.86 
 
 		 430 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0706  L-rhamnose isomerase  26.22 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  26.85 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1726  xylose isomerase-like TIM barrel  23.97 
 
 		 429 aa  49.7  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2256  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1849  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.74 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2856  L-rhamnose isomerase  25.4 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  20.89 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3573  L-rhamnose catabolism isomerase  22.43 
 
 		 430 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  23.93 
 
 		 268 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  23.5 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  23.96 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  24.48 
 
 		 388 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2116  L-rhamnose catabolism isomerase  23.35 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  24.88 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1078  xylose isomerase domain-containing protein  30.95 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  23.64 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  26.67 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  26.11 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4673  L-rhamnose isomerase  22.28 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239648  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3703  L-rhamnose isomerase  26.04 
 
 		 387 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3306  L-rhamnose isomerase  31.82 
 
 		 388 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.984678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.91 
 
 		 322 aa  42.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>