69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4598 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  27.05 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.04 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.85 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  24.28 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  26.11 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  28.06 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  31.14 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  29.94 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.65 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.41 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  31.37 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.76 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  27.31 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  27.31 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.98 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  25.28 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  26.92 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3304  xylose isomerase domain-containing protein  30.38 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  28.08 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  26.67 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  36.67 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  28.43 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  29.94 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  26.74 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  23.7 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.26 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  28.04 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  30.68 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.14 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  26.32 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.77 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  28.49 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  26.67 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  25.88 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  24.64 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  28.5 
 
 		 237 aa  52.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  28.07 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  24.22 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  25.6 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  25.57 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  27.12 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.64 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.98 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18060  sugar phosphate isomerase/epimerase  22.73 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  27.96 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.57 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  27.42 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  31.11 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.41 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  23.28 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  26.89 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  24.68 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1550  AP endonuclease  25.2 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  32.08 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.62 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.86 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  24.08 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.98 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  23.96 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  25.41 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  31 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.52 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.33 
 
 		 290 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  26.7 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.2 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.71 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  22.7 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>