43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1550 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1550  AP endonuclease  100 
 
 		 247 aa  496  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0548  xylose isomerase domain-containing protein  25.7 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000681576  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  27.56 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  28.02 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2742  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.83 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.492368 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  26.75 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  27.75 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  27.23 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  23.04 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  22.53 
 
 		 289 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  25.82 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  23.69 
 
 		 300 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  25.15 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  27.22 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  28 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  23.98 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  30.81 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  22.67 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  22.67 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  22.67 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  23 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  24.68 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  26.14 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  24 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  24.76 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  25.2 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  24.34 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.08 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.65 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  25.41 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  23.03 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  26.92 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  29.25 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  32.91 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  24.49 
 
 		 298 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  23.6 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  22.96 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.28 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  25.95 
 
 		 255 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  25.97 
 
 		 253 aa  42  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  24.56 
 
 		 282 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  26.26 
 
 		 298 aa  42  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>