82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4159 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 257 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  64.06 
 
 		 256 aa  360  9e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  65.35 
 
 		 256 aa  355  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  63.39 
 
 		 256 aa  344  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  63.39 
 
 		 256 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  59.84 
 
 		 255 aa  322  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.79 
 
 		 255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  41.11 
 
 		 257 aa  221  8e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  32.81 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  29.43 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  30.95 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.61 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.74 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.71 
 
 		 282 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  26.38 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  26.74 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  27.08 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  25.98 
 
 		 268 aa  95.9  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  27.46 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  28.75 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  33 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  31.77 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  30.2 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  25.96 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.96 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1928  hypothetical protein  29.84 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  27.7 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  25.5 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  25.54 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.71 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  31.65 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.86 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.7 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  29.15 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  31 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.64 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.53 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  29.09 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  30.37 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  26.99 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  27.96 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  25.94 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  28.08 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.84 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  27.72 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.44 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  26.05 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  30.49 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.32 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.41 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  28.81 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  27.98 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  26.79 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  27.69 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  21.46 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5712  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.12 
 
 		 290 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  25.71 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  25 
 
 		 323 aa  49.3  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.9 
 
 		 749 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.9 
 
 		 749 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.7 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1550  AP endonuclease  26.14 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  30.3 
 
 		 748 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  26.47 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  24.04 
 
 		 281 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.28 
 
 		 276 aa  45.4  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.8 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  26.82 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  26.35 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2200  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.26 
 
 		 749 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  29.13 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3194  hypothetical protein  24 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0561892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2313  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 616 aa  42.4  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.01 
 
 		 314 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  23.86 
 
 		 304 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  26.77 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  21.36 
 
 		 384 aa  42  0.009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  27.8 
 
 		 282 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  27.22 
 
 		 285 aa  42  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  24.65 
 
 		 283 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  28.57 
 
 		 281 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>