More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0779 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 276 aa  554  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  45.22 
 
 		 274 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  35.02 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.92 
 
 		 282 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  29.14 
 
 		 281 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2911  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.73 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2684  xylose isomerase domain-containing protein  34.35 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3593  xylose isomerase domain-containing protein  32.82 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  decreased coverage  0.000150106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.97 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  27.37 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.19 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2286  xylose isomerase domain-containing protein  32.97 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0370511  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.43 
 
 		 480 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.68 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0982928  normal  0.0112247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.11 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1810  xylose isomerase domain-containing protein  28.27 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.753291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.51 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2772  xylose isomerase domain-containing protein  22.7 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.549003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1679  xylose isomerase domain-containing protein  24.41 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.24 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.73 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2321  xylose isomerase domain-containing protein  22.4 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  22.9 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1244  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  23.05 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.341536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  26.44 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3575  xylose isomerase domain-containing protein  28.4 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2748  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.32 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.652978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2927  xylose isomerase domain-containing protein  21.82 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837933  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3407  hydroxypyruvate isomerase  32.22 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  decreased coverage  0.0000181243 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  32.3 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0945  xylose isomerase-like TIM barrel  22.11 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879537  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1427  xylose isomerase domain-containing protein  22.11 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1405  xylose isomerase domain-containing protein  22.11 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  28.57 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4718  protein IolH  24.24 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.745442  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0015  hydroxypyruvate isomerase  25.87 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.15 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4571  xylose isomerase-like TIM barrel  21.77 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.985344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  24.29 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  24.48 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1307  xylose isomerase domain-containing protein  22.11 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.8 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.4 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1346  xylose isomerase domain-containing protein  22.15 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  23.19 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.19 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  23.19 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  22.7 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0388  xylose isomerase domain-containing protein  23.78 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  29.7 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1888  xylose isomerase domain-containing protein  21.82 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  23.19 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.94 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  23.4 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  25.68 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  23.19 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  26.05 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  26.28 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.51 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  22.81 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  22.81 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.11 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0943  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.51 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  23.55 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  22.81 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  23.23 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  27.13 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  25.97 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4657  xylose isomerase domain-containing protein  23.37 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.97 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.51 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  23.24 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0423  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.63 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  23.95 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  25.38 
 
 		 843 aa  59.7  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.58 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3493  iolH protein  23 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00667421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  26.52 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50120  myo-inositol catabolism protein IolH  22.03 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.19 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3267  AP endonuclease  22.65 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0839  xylose isomerase domain-containing protein  26.13 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.276132  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  24.66 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  25.58 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  24.62 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  25.17 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  23.83 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.93 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72992  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.09 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0826  xylose isomerase domain-containing protein  22.86 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  26.07 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  24.41 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.77 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2628  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.54 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0345  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.48 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.66 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  26.07 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  26.07 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  26.07 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>