178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1580 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.14 
 
 
762 aa  786    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.147767  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  53.81 
 
 
761 aa  801    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 
749 aa  1542    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.1 
 
 
749 aa  914    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.1 
 
 
749 aa  914    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  58.61 
 
 
748 aa  917    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  40.55 
 
 
330 aa  254  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  39.47 
 
 
349 aa  248  3e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  38.82 
 
 
331 aa  240  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.22 
 
 
359 aa  239  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  38.41 
 
 
334 aa  238  3e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  40 
 
 
337 aa  233  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  37.36 
 
 
341 aa  229  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  37.54 
 
 
333 aa  228  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  41.93 
 
 
394 aa  229  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  37.27 
 
 
333 aa  227  5.0000000000000005e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  40.63 
 
 
363 aa  225  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  40.24 
 
 
333 aa  225  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  40 
 
 
337 aa  223  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  39.44 
 
 
357 aa  221  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.6 
 
 
335 aa  221  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  40.98 
 
 
333 aa  221  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  41.57 
 
 
342 aa  219  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.14 
 
 
357 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  42.01 
 
 
303 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  37.04 
 
 
347 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.46 
 
 
334 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.46 
 
 
334 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.77 
 
 
354 aa  218  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.66 
 
 
357 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  38.31 
 
 
357 aa  216  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  38.31 
 
 
357 aa  216  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  36.56 
 
 
348 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.96 
 
 
350 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  39.36 
 
 
350 aa  213  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.95 
 
 
350 aa  212  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.16 
 
 
332 aa  212  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  35.06 
 
 
334 aa  211  3e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  34.93 
 
 
334 aa  209  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  32.46 
 
 
346 aa  209  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  41.99 
 
 
672 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37 
 
 
358 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  34.32 
 
 
346 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.45 
 
 
338 aa  204  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.83 
 
 
350 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  37.64 
 
 
348 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  38.35 
 
 
348 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  36.01 
 
 
351 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  37.03 
 
 
351 aa  197  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.56 
 
 
334 aa  195  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  32.46 
 
 
341 aa  194  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  34.01 
 
 
343 aa  194  7e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  39.32 
 
 
360 aa  194  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  37.33 
 
 
359 aa  193  8e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  36.39 
 
 
350 aa  193  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.12 
 
 
314 aa  193  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  39.58 
 
 
289 aa  192  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2841  N-acetylneuraminate synthase  41.45 
 
 
300 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893161  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1072  sialic acid synthase  38.41 
 
 
293 aa  191  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  33.13 
 
 
337 aa  190  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36 
 
 
350 aa  190  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.44 
 
 
344 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.96 
 
 
349 aa  189  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0843  N-acetylneuraminate synthase  41.54 
 
 
296 aa  188  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1187  N-acetylneuraminate synthase  38.54 
 
 
289 aa  188  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2713  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40 
 
 
310 aa  188  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.314547  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0910  N-acetylneuraminate synthase  40.88 
 
 
289 aa  187  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  35.38 
 
 
340 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.2 
 
 
354 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  33.85 
 
 
338 aa  183  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1574  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.06 
 
 
289 aa  183  8.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000030231  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  35.08 
 
 
340 aa  183  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.23 
 
 
356 aa  182  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  35.37 
 
 
335 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.72 
 
 
350 aa  181  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  33.63 
 
 
350 aa  180  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.6 
 
 
349 aa  180  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  34.8 
 
 
349 aa  177  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  35.4 
 
 
350 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.83 
 
 
355 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  33.04 
 
 
349 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  34.01 
 
 
343 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  33.82 
 
 
350 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  34.43 
 
 
345 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  31.74 
 
 
342 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  32.74 
 
 
352 aa  173  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.44 
 
 
338 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  32.54 
 
 
349 aa  172  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.73 
 
 
349 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.93 
 
 
343 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0346  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.68 
 
 
313 aa  171  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  32.85 
 
 
343 aa  171  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.23 
 
 
345 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  34.69 
 
 
338 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.28 
 
 
358 aa  168  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  32.83 
 
 
342 aa  167  5e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.14 
 
 
351 aa  167  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2396  NeuB, antifreeze-like protein  37.75 
 
 
371 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  32.55 
 
 
350 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  31.95 
 
 
359 aa  164  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>