57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2200 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2200  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2335  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.75 
 
 		 271 aa  228  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0499  xylose isomerase domain-containing protein  43.7 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0778  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.98 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0102757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.64 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0346457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.31 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.57 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0433  xylose isomerase domain-containing protein  27.04 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1444  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.92 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3626  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.04 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4310  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.82 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 843 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1134  xylose isomerase domain-containing protein  29.87 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.155957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.21 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.15 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  29.76 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0121  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.39 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.55 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  26.12 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  32.7 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.32 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.98 
 
 		 280 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  24.64 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3717  xylose isomerase-like TIM barrel  23.89 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.116352  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.72 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.56 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0287  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.82 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.58 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.94 
 
 		 536 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.52 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.27 
 
 		 828 aa  45.8  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.87 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.85 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2929  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.74 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.712071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3194  hypothetical protein  26.17 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0561892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.88 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  20.45 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.3 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2848  xylose isomerase-like TIM barrel  27.41 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.561386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3697  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.15 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1941  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.82 
 
 		 148 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 		 699 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3894  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.15 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2144  hypothetical protein  30.68 
 
 		 148 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1682  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.16 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.61 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2120  hypothetical protein  26.17 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.565953  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1993  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.14 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2729  xylose isomerase domain-containing protein  34.72 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5223  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.34 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539656  normal  0.643563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.77 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2628  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.95 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1917  sugar phosphate isomerase/epimerase  30.68 
 
 		 148 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0649  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.24 
 
 		 282 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.12 
 
 		 278 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72992  normal  0.677617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>