100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0323 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 
536 aa  1105    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0413  xylose isomerase domain-containing protein  30.25 
 
 
299 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0344  AP endonuclease  30.25 
 
 
299 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5751  xylose isomerase domain-containing protein  27.97 
 
 
304 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3434  xylose isomerase domain-containing protein  26.96 
 
 
303 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194005  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3708  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.42 
 
 
286 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5488  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.77 
 
 
285 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.28 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  26.11 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.38 
 
 
278 aa  73.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1361  xylose isomerase domain-containing protein  22.14 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5223  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.55 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539656  normal  0.643563 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1208  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.59 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3890  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  28.29 
 
 
286 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3874  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  28.29 
 
 
286 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  27.42 
 
 
279 aa  64.3  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3954  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.91 
 
 
286 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3999  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.91 
 
 
286 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.873782 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4061  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.91 
 
 
286 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0121  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.68 
 
 
290 aa  62.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0287  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.9 
 
 
290 aa  62.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  25.35 
 
 
263 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3786  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.13 
 
 
286 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3905  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.13 
 
 
286 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3816  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.75 
 
 
284 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643692 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0132  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.13 
 
 
286 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482678  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3796  hexulose-6-phosphate isomerase  25.75 
 
 
284 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.542065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0128  hexulose-6-phosphate isomerase  27.13 
 
 
286 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4727  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.75 
 
 
284 aa  61.2  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2848  xylose isomerase-like TIM barrel  23.56 
 
 
282 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.561386  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04026  hypothetical protein  25.75 
 
 
284 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04064  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.75 
 
 
284 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4441  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.75 
 
 
284 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4758  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.75 
 
 
284 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5713  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.75 
 
 
284 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4668  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.75 
 
 
284 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4079  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  26.74 
 
 
286 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2729  xylose isomerase domain-containing protein  24.54 
 
 
281 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03434  predicted L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  26.74 
 
 
286 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1808  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.88 
 
 
299 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.011927  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03385  hypothetical protein  26.74 
 
 
286 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4805  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25 
 
 
284 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.296767  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4655  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25 
 
 
284 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4784  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25 
 
 
284 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.871942  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3269  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.37 
 
 
293 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0931  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.64 
 
 
293 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.298482 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4748  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.64 
 
 
284 aa  57.4  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3402  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.64 
 
 
293 aa  57  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.72 
 
 
282 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4665  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.64 
 
 
284 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.91 
 
 
262 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3894  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.09 
 
 
286 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3697  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.09 
 
 
286 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  23.13 
 
 
266 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1320  hexulose-6-phosphate isomerase  23.02 
 
 
289 aa  54.7  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.5 
 
 
290 aa  53.9  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3938  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.73 
 
 
286 aa  53.5  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2872  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.22 
 
 
300 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00133727  normal  0.0357921 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5486  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.89 
 
 
281 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.248686 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.43 
 
 
278 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.44 
 
 
275 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1348  hypothetical protein  21.13 
 
 
271 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.359859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  23.17 
 
 
255 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0988  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.09 
 
 
294 aa  50.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0393582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3194  hypothetical protein  27.11 
 
 
269 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0561892  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2777  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.55 
 
 
295 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.62 
 
 
277 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2147  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.27 
 
 
281 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.634392  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.11 
 
 
293 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  24.28 
 
 
843 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.51 
 
 
331 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3195  hydroxypyruvate isomerase  29.03 
 
 
263 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568718  normal  0.0120723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  24.79 
 
 
271 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.1 
 
 
284 aa  47.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.08 
 
 
258 aa  47.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1812  xylose isomerase domain-containing protein  25.61 
 
 
329 aa  47  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2200  xylose isomerase domain-containing protein  29.94 
 
 
288 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.26 
 
 
292 aa  47  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  26.48 
 
 
303 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  27.4 
 
 
283 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0948  xylose isomerase domain-containing protein  25.96 
 
 
272 aa  47  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 
699 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  29.68 
 
 
279 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4616  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.85 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  25.62 
 
 
287 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.66 
 
 
273 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1717  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.36 
 
 
275 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.91 
 
 
297 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2296  xylose isomerase domain-containing protein  26.03 
 
 
284 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  0.299582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2120  hypothetical protein  28.46 
 
 
269 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.565953  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1462  xylose isomerase-like  23.04 
 
 
304 aa  44.3  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0792814  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5712  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.86 
 
 
290 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 
699 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.68 
 
 
294 aa  43.9  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  27 
 
 
266 aa  43.9  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0499  xylose isomerase domain-containing protein  30.06 
 
 
282 aa  43.9  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.07 
 
 
278 aa  43.5  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0542  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.19 
 
 
250 aa  43.5  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  22.39 
 
 
304 aa  43.5  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.41 
 
 
282 aa  43.5  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>