30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0948 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0948  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  553  1e-156  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  33.83 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1208  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.72 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2872  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.39 
 
 		 300 aa  90.1  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00133727  normal  0.0357921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  26.96 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0772  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.692507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  28.24 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  28 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  23.81 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0121  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.83 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.47 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  29.75 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  27.57 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1993  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27 
 
 		 287 aa  48.9  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  27.85 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.96 
 
 		 536 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5791  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.3 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.864508  normal  0.0412869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0458  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.5 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0986  xylose isomerase domain-containing protein  21.97 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  20.6 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  26.04 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.23 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2848  xylose isomerase-like TIM barrel  20.19 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.561386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.27 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  0.603305 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.32 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.382585 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  27.27 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0568  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.19 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1811  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.9 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00140377  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  28.78 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>