More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1297 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.62 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39 
 
 
282 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  36.96 
 
 
270 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1959  AP endonuclease, family 2  32.66 
 
 
262 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0839995  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01291  predicted enzyme  32.26 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.26 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1429  AP endonuclease  32.26 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01302  hypothetical protein  32.26 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2311  xylose isomerase domain-containing protein  32.26 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1528  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.78 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1808  AP endonuclease  32.26 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2160  xylose isomerase domain-containing protein  31.18 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.26775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1524  AP endonuclease  31.85 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  43.61 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  34.08 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.53 
 
 
283 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  34.25 
 
 
283 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.06 
 
 
275 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.86 
 
 
289 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5867  xylose isomerase domain-containing protein  32.29 
 
 
295 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102013  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1251  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.41 
 
 
274 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725023  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  31.4 
 
 
289 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.44 
 
 
279 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.33 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.65 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263775  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  29.92 
 
 
295 aa  96.3  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.53 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.22 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.89 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.82 
 
 
288 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  37.82 
 
 
297 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  31.46 
 
 
295 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  31.46 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0259  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.92 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0533  xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.74 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.605213  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1969  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.31 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.32 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  31.58 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.78 
 
 
297 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4619  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.04 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154569  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.62 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.96 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4538  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.59 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.535239 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  31.01 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.71 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3174  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.84 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  37.19 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  29.01 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12330  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.84 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205248  normal  0.361397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  29.41 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0288  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.54 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341149  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3635  xylose isomerase domain-containing protein  36.11 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1112  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.79 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  30.83 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  30.83 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  30.83 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3261  hypothetical protein  31.05 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.879119  normal  0.639309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1902  xylose isomerase domain-containing protein  35.59 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3575  xylose isomerase domain-containing protein  29.95 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  30.08 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4202  hydroxypyruvate isomerase  34.48 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  35.65 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  28.57 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1554  putative isomerase  27.82 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  0.610325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1301  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.71 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00429624  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  29.58 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2201  xylose isomerase domain-containing protein  31.51 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  30.57 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.11 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  28.12 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  27.82 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3631  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.21 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9121  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2228  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.67 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498591  normal  0.437814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  28.89 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29590  sugar phosphate isomerase/epimerase  32.23 
 
 
739 aa  66.2  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  28.78 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31430  Xylose isomerase-like TIM barrel protein, probably inolved in myo-inositol catabolism  28.57 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.161007  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4572  hydroxypyruvate isomerase  33.91 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  28.33 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  28.33 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  25.23 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3195  hydroxypyruvate isomerase  28.74 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568718  normal  0.0120723 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  27.48 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  28.69 
 
 
259 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.03 
 
 
264 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  normal  0.0990251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  28.57 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.85 
 
 
286 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2411  xylose isomerase domain-containing protein  32.03 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.8 
 
 
278 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  0.603305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  32.85 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  31.71 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  26.4 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  27.42 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5018  hydroxypyruvate isomerase  30.53 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  28.69 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  27.07 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4012  xylose isomerase domain-containing protein  30.11 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167546  normal  0.990546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>