273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4652 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  100 
 
 
290 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  67.84 
 
 
290 aa  361  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12330  sugar phosphate isomerase/epimerase  66.78 
 
 
288 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205248  normal  0.361397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4538  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.77 
 
 
281 aa  202  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.535239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.63 
 
 
290 aa  198  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.86 
 
 
289 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.74 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.07 
 
 
297 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  32.99 
 
 
289 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.07 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  31.86 
 
 
295 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  30.82 
 
 
295 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0533  xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.16 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.605213  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4619  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.71 
 
 
282 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154569  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.9 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.15 
 
 
285 aa  125  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 
282 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.59 
 
 
292 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3635  xylose isomerase domain-containing protein  29.79 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  31.45 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5867  xylose isomerase domain-containing protein  35.1 
 
 
295 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102013  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  33.09 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  34.02 
 
 
268 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  29.43 
 
 
297 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3174  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.14 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  26.79 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.57 
 
 
282 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  47.66 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  32.33 
 
 
270 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.65 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263775  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.62 
 
 
279 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.55 
 
 
288 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  22.45 
 
 
283 aa  98.6  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0259  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.91 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0288  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.26 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341149  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1251  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.38 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.64 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3261  hypothetical protein  26.35 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.879119  normal  0.639309 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.09 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1969  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.85 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.19 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4194  xylose isomerase-like TIM barrel  27.92 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2978  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.34 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.856422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3141  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.34 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  28.4 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1112  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.21 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1808  AP endonuclease  28.31 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01291  predicted enzyme  28.31 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.31 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2311  xylose isomerase domain-containing protein  28.31 
 
 
262 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1429  AP endonuclease  28.31 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01302  hypothetical protein  28.31 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2160  xylose isomerase domain-containing protein  35.19 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.26775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  30.91 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  33.08 
 
 
262 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1959  AP endonuclease, family 2  28.48 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0839995  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  31.9 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4228  xylose isomerase domain-containing protein  29.82 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1524  AP endonuclease  27.71 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3367  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.5 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2201  xylose isomerase domain-containing protein  28.64 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  32.23 
 
 
269 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.07 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313924  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  31.4 
 
 
269 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  31.4 
 
 
269 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  27.89 
 
 
271 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  31.4 
 
 
269 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  31.4 
 
 
269 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  31.4 
 
 
269 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  29.6 
 
 
259 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  32.21 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5018  hydroxypyruvate isomerase  32 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  27.27 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  31.4 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  32.14 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3195  hydroxypyruvate isomerase  32.64 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568718  normal  0.0120723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  32.14 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  25.95 
 
 
258 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  33.57 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5990  xylose isomerase domain-containing protein  26.63 
 
 
339 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0730403  normal  0.114286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  28.9 
 
 
262 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  28.9 
 
 
262 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  28.9 
 
 
262 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1041  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.21 
 
 
298 aa  58.9  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.4 
 
 
303 aa  58.9  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  26.03 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  26.61 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  26.03 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  26.03 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1528  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.56 
 
 
264 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  26.61 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2682  xylose isomerase domain-containing protein  28.18 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.84 
 
 
334 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  32.28 
 
 
288 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06440  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.37 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  30.49 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  26.7 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6726  putative endonuclease protein  33.06 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  28.39 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  36.21 
 
 
264 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>