225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1041 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1041  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 298 aa  617  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2687  twin-arginine translocation pathway signal  65.38 
 
 		 301 aa  363  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00433  Twin-arginine translocation pathway signal  61.23 
 
 		 309 aa  351  8e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.45 
 
 		 293 aa  349  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3461  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.51 
 
 		 293 aa  312  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0423  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.86 
 
 		 287 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1032  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.95 
 
 		 272 aa  299  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0698  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.95 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1033  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.37 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2364  xylose isomerase domain-containing protein  49.2 
 
 		 294 aa  265  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.807591  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2976  xylose isomerase domain-containing protein  46.85 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.3 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.331171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2533  xylose isomerase domain-containing protein  35.74 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.685925  normal  0.744094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0431  xylose isomerase domain-containing protein  32.59 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3052  xylose isomerase domain-containing protein  29.39 
 
 		 256 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0431176 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  37.08 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  29.69 
 
 		 256 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  30.67 
 
 		 260 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  34.62 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  28.63 
 
 		 260 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  29.07 
 
 		 260 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  30.22 
 
 		 260 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  34.39 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  28.63 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  28.63 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  28.19 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  33.12 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  28.16 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  32.08 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  35.82 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  25.81 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  37.5 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  37.5 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  37.5 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  37.5 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  37.5 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  26.91 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  31.76 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  32.88 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  36.36 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  33.12 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  32.88 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  32.88 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  31.76 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  29.03 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  28.92 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  32.9 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  36.61 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  27.11 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  34.23 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  33.79 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  28.7 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3564  xylose isomerase domain-containing protein  31.14 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1026  hydroxypyruvate isomerase  29.36 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5294  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.58 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  25.21 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  32.43 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  30.94 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.12 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  28.51 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  32.14 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  26.46 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  25.81 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2268  Hydroxypyruvate isomerase  26.58 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  34.23 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  27.56 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  26.48 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  29.02 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  25.69 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  33.91 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3611  hydroxypyruvate isomerase  27.48 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4157  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.31 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.831007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  33.03 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  32.61 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  28.49 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5307  Hydroxypyruvate isomerase  31.25 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314618  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  26.69 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  34.23 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  29.82 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31430  Xylose isomerase-like TIM barrel protein, probably inolved in myo-inositol catabolism  35.04 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.161007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  34.23 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  26.46 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  34.57 
 
 		 265 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2898  putative sugar isomerase (interconverting aldoses and ketoses)  26.82 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.0851666 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3899  hydroxypyruvate isomerase  23.31 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  32.43 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  30.33 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  28.44 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4012  xylose isomerase domain-containing protein  32.81 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167546  normal  0.990546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  24.66 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2758  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.56 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  31.45 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1913  Hydroxypyruvate isomerase  32.43 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  32.43 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  32.74 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  31.25 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1855  hydroxypyruvate isomerase  32.11 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>