207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0431 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0431  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  671    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0423  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.44 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2976  xylose isomerase domain-containing protein  38.66 
 
 		 295 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00433  Twin-arginine translocation pathway signal  36.4 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2687  twin-arginine translocation pathway signal  38.69 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0698  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.69 
 
 		 297 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2364  xylose isomerase domain-containing protein  36.03 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.807591  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3461  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.47 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.55 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.331171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1041  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.59 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.03 
 
 		 293 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1033  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.77 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1032  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.62 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2533  xylose isomerase domain-containing protein  47.17 
 
 		 259 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.685925  normal  0.744094 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  32.42 
 
 		 250 aa  99.4  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3052  xylose isomerase domain-containing protein  37.06 
 
 		 256 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0431176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1301  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.88 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00429624  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  31.55 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2503  hydroxypyruvate isomerase  36.13 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  31.44 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  32.32 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  31.36 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  31.64 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  37.39 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  32.39 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  32.04 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  30.68 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  36.75 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  38.58 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2898  putative sugar isomerase (interconverting aldoses and ketoses)  27.6 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.0851666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  32.2 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  32.4 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  32.2 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  30.56 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  32.2 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  32.2 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  27.44 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  30.58 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  36.44 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  37.8 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  32.2 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  37.72 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  31.25 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  30.11 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  34.15 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2268  Hydroxypyruvate isomerase  30.05 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  31.31 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  34.17 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  29.95 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  33.87 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2086  hydroxypyruvate isomerase  29.24 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  27.78 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  34.75 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  30.22 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  31.64 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  31.67 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  31.03 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  30.94 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  30.41 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  35.96 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  35.96 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  35.96 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  35.96 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  35.96 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  29.65 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  32.16 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  30.77 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  30.34 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  34.62 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  35.09 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5307  Hydroxypyruvate isomerase  27.44 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314618  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  27.69 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  28.98 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1855  hydroxypyruvate isomerase  32.43 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  28.34 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  33.61 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  36 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  33.61 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.7 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  28.34 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  28.34 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2604  xylose isomerase domain-containing protein  37.4 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1554  putative isomerase  28.65 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  0.610325 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  29.41 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3611  hydroxypyruvate isomerase  27.98 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  28.98 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  25.68 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  30.15 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  29.48 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5011  Hydroxypyruvate isomerase  28.48 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.3021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  25.97 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  33.62 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  33.62 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  26.23 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  33.62 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4012  xylose isomerase domain-containing protein  38.26 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167546  normal  0.990546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4098  hydroxypyruvate isomerase  30.68 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  33.62 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>