More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1698 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  100 
 
 		 268 aa  541  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.43 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.53 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5867  xylose isomerase domain-containing protein  37.56 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.75 
 
 		 295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.94 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  36.53 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.98 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  35.09 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  34.02 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4538  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.75 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.535239 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1251  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.44 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725023  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.08 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.95 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.16 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  37.67 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.77 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.62 
 
 		 288 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  37.22 
 
 		 295 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3635  xylose isomerase domain-containing protein  31.22 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  31.39 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0533  xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.3 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.605213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  29.63 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.87 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  36.28 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.42 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12330  sugar phosphate isomerase/epimerase  34.15 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205248  normal  0.361397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0259  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.93 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.92 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  47.75 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  31.03 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.57 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2160  xylose isomerase domain-containing protein  29.72 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.26775 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.22 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1528  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.95 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  32.54 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0288  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.36 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.46 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  31.23 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1808  AP endonuclease  29.32 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01291  predicted enzyme  27.71 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.71 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1429  AP endonuclease  27.71 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01302  hypothetical protein  27.71 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1524  AP endonuclease  27.71 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4619  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.33 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154569  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3261  hypothetical protein  34.48 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.879119  normal  0.639309 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2311  xylose isomerase domain-containing protein  27.71 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1959  AP endonuclease, family 2  27.17 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0839995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5018  hydroxypyruvate isomerase  31.22 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1554  putative isomerase  29.3 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  0.610325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3174  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.76 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  30.56 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2687  twin-arginine translocation pathway signal  26.27 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.25 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  30.84 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2228  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.28 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498591  normal  0.437814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  25.5 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.5 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  25.5 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.13 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  25.5 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  25.1 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  25.1 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  25.1 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1032  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.21 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  30.45 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00433  Twin-arginine translocation pathway signal  25.1 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1969  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.61 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  30.23 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1041  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  28.8 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  25.1 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.05 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  27.06 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1033  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5294  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.47 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  28.31 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3631  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9121  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.79 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  26.42 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  26.02 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  25.64 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  27.87 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  26.42 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  26.42 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3195  hydroxypyruvate isomerase  27.95 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568718  normal  0.0120723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  26.42 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1301  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.16 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00429624  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  26.42 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3461  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.4 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0423  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.1 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  26.42 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3052  xylose isomerase domain-containing protein  21.99 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0431176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  24.32 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  24.24 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  25 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>