233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2160 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2160  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 
262 aa  548  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.26775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01291  predicted enzyme  83.97 
 
 
262 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  83.97 
 
 
262 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01302  hypothetical protein  83.97 
 
 
262 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1524  AP endonuclease  83.97 
 
 
262 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1429  AP endonuclease  83.97 
 
 
262 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1808  AP endonuclease  83.59 
 
 
262 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1959  AP endonuclease, family 2  82.82 
 
 
262 aa  461  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0839995  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2311  xylose isomerase domain-containing protein  83.59 
 
 
262 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1528  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  64.37 
 
 
264 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.84 
 
 
264 aa  198  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.18 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.72 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  35.82 
 
 
278 aa  96.3  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  42.06 
 
 
289 aa  92  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.09 
 
 
282 aa  89  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 
270 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.48 
 
 
292 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1251  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.25 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.91 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.57 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  34.38 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  37.74 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.17 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.06 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3174  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.81 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  32.38 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  32.61 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29590  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.67 
 
 
739 aa  72  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.4 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.29 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0533  xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.74 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.605213  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.75 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4538  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.64 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.535239 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0259  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.17 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  32.09 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  37.27 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.72 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2682  xylose isomerase domain-containing protein  31.2 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  25.27 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.69 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  31.45 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2201  xylose isomerase domain-containing protein  32.08 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  35.19 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5867  xylose isomerase domain-containing protein  25.62 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102013  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4202  hydroxypyruvate isomerase  33.61 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3689  xylose isomerase domain-containing protein  32.43 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  27.92 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  27.92 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.03 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263775  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.91 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  31.06 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  31.37 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4619  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.19 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154569  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3635  xylose isomerase domain-containing protein  28.79 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  27.31 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4572  hydroxypyruvate isomerase  35.85 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0288  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.32 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341149  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.19 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08170  hydroxypyruvate isomerase  33.64 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.461944  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  30.14 
 
 
280 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  31.78 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.53 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  27.27 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  24.71 
 
 
259 aa  62.4  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1969  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.61 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0721  Hydroxypyruvate isomerase  29.91 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0339  Hydroxypyruvate isomerase  32.08 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0554  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.33 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  26.14 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0246  Hydroxypyruvate isomerase  32.41 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1301  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.41 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00429624  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  29.93 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  28.15 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  25.96 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4157  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.61 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.831007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1554  putative isomerase  25.37 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  0.610325 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  27.63 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  29.79 
 
 
269 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2268  Hydroxypyruvate isomerase  31.45 
 
 
281 aa  58.9  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  29.79 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2546  Hydroxypyruvate isomerase  30.58 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0308483  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3899  hydroxypyruvate isomerase  26.32 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  29.08 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3261  hypothetical protein  27.75 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.879119  normal  0.639309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1902  xylose isomerase domain-containing protein  30.09 
 
 
299 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  28.69 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  30.19 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  25 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  25.17 
 
 
287 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2604  xylose isomerase domain-containing protein  32.28 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2898  putative sugar isomerase (interconverting aldoses and ketoses)  31.85 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.0851666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.79 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  31.9 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  33.87 
 
 
262 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.69 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  31.36 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1855  hydroxypyruvate isomerase  31.34 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>