85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4228 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4228  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  535  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1876  xylose isomerase domain-containing protein  35.32 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1942  xylose isomerase domain-containing protein  35.32 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1896  xylose isomerase-like TIM barrel  35.32 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2495  xylose isomerase domain-containing protein  34.44 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4578  xylose isomerase domain-containing protein  38.41 
 
 		 137 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.615471  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6726  putative endonuclease protein  32.59 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1719  hypothetical protein  31.25 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.97 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.41 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  0.603305 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.24 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4007  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.83 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.59 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  26.72 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1107  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4011  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.7 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.82 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2394  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.29 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515446  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0137  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.95 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2177  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.85 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000702324 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3803  xylose isomerase domain-containing protein  30.16 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465718  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4453  AP endonuclease  30.16 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121679  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.22 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2281  hitchhiker  0.0000101278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3334  xylose isomerase domain-containing protein  29.7 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4771  AP endonuclease  30.16 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4680  AP endonuclease  30.16 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.110375  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04075  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0808004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04037  hypothetical protein  29.37 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06440  sugar phosphate isomerase/epimerase  30.07 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3367  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2423  xylose isomerase domain-containing protein  32 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0964314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2853  xylose isomerase domain-containing protein  32.26 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2459  xylose isomerase domain-containing protein  32.26 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0140499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4709  myo-inositol catabolism protein  28.09 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0492702  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.71 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0606369  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  22.56 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  28.67 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1856  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.13 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  30.23 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.31 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.834913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5095  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.57 
 
 		 604 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0615  xylose isomerase domain-containing protein  27.04 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12330  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.07 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205248  normal  0.361397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 290 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1081  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  33.06 
 
 		 628 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796659  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5867  xylose isomerase domain-containing protein  30.47 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  30.43 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.23 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362033  normal  0.0199285 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.27 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2059  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  29.69 
 
 		 687 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0418  xylose isomerase domain-containing protein  27.72 
 
 		 635 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  27.97 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.11 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0292  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.49 
 
 		 615 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3593  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.6 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.71 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  29.81 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.88 
 
 		 318 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.22 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  30.71 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.68 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.13 
 
 		 284 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24 
 
 		 262 aa  45.4  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4567  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.21 
 
 		 627 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0481  AP endonuclease  32.11 
 
 		 684 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0848  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  32.11 
 
 		 684 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1894  putative amino acid dioxygenase  32.11 
 
 		 684 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1752  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  32.11 
 
 		 684 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10433  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2205  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  32.11 
 
 		 684 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0577  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  32.11 
 
 		 687 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0891  AP endonuclease  32.11 
 
 		 684 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.940921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1902  xylose isomerase domain-containing protein  26.71 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  23.69 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.4 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.54 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  29.68 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.45 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4496  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.39 
 
 		 638 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0882  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  31.87 
 
 		 627 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1969  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.63 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0343  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  32.29 
 
 		 630 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.57 
 
 		 288 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  25.37 
 
 		 268 aa  42  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>