76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3593 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3593  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 265 aa  514  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.83 
 
 		 276 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2281  hitchhiker  0.0000101278 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4011  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.08 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4007  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.83 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3334  xylose isomerase domain-containing protein  50.38 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6726  putative endonuclease protein  50.91 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1107  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.28 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1719  hypothetical protein  50.75 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  48.3 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0137  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.31 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4680  AP endonuclease  44.32 
 
 		 280 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.110375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3803  xylose isomerase domain-containing protein  43.96 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465718  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4453  AP endonuclease  43.96 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2853  xylose isomerase domain-containing protein  46.59 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4771  AP endonuclease  43.96 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.87 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.834913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04037  hypothetical protein  43.59 
 
 		 280 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04075  conserved hypothetical protein  43.59 
 
 		 280 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0808004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2459  xylose isomerase domain-containing protein  47.76 
 
 		 292 aa  214  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0140499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2423  xylose isomerase domain-containing protein  45.02 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0964314  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  45.93 
 
 		 288 aa  208  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1856  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.33 
 
 		 292 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06440  sugar phosphate isomerase/epimerase  44.33 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3367  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.72 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.82 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362033  normal  0.0199285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.8 
 
 		 296 aa  198  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0615  xylose isomerase domain-containing protein  41.96 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  39.93 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.64 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  0.603305 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4176  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.79 
 
 		 394 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346853  hitchhiker  0.000695283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2882  xylose isomerase domain-containing protein  43.85 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2177  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.39 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000702324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.22 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.47 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0606369  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2394  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.86 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  29.43 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2495  xylose isomerase domain-containing protein  26.44 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3816  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.88 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643692 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5713  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.88 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  28.4 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4805  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  28.63 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.296767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4441  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.88 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4758  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.88 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04026  hypothetical protein  27.88 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4668  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.88 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  28.4 
 
 		 295 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04064  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.88 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3796  hexulose-6-phosphate isomerase  26.91 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.542065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  31.94 
 
 		 290 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4655  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  29.07 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4784  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  29.07 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.871942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1876  xylose isomerase domain-containing protein  30.28 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12330  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.61 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205248  normal  0.361397 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4748  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  28.63 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  29.61 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1896  xylose isomerase-like TIM barrel  30.54 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.88 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1942  xylose isomerase domain-containing protein  30.54 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3955  xylose isomerase domain-containing protein  33.5 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00177251  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4665  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  28.63 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4727  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  27.43 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0409  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.53 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4228  xylose isomerase domain-containing protein  30.57 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.46 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29270  sugar phosphate isomerase/epimerase  33.33 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  25.27 
 
 		 297 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.53 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1477  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.78 
 
 		 596 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0115  xylose isomerase domain-containing protein  27.31 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99603  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  28.89 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3597  xylose isomerase domain-containing protein  32.69 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.791675  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  20.32 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3702  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.53 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  26.99 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>