38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2495 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2495  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 261 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1896  xylose isomerase-like TIM barrel  63.08 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1942  xylose isomerase domain-containing protein  63.08 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1876  xylose isomerase domain-containing protein  62.69 
 
 		 264 aa  317  9e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4228  xylose isomerase domain-containing protein  34.44 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4578  xylose isomerase domain-containing protein  47.79 
 
 		 137 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.615471  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.06 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  0.603305 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2394  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.5 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.9 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4007  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  29.88 
 
 		 278 aa  62  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4176  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.65 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346853  hitchhiker  0.000695283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2459  xylose isomerase domain-containing protein  30.18 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0140499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1719  hypothetical protein  29.94 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.86 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3334  xylose isomerase domain-containing protein  29.17 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.24 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2281  hitchhiker  0.0000101278 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3593  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.44 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4011  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.24 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3367  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.95 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1107  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.06 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2853  xylose isomerase domain-containing protein  30.59 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04075  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0808004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04037  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.1 
 
 		 286 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.29 
 
 		 274 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362033  normal  0.0199285 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3803  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465718  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4453  AP endonuclease  25 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6726  putative endonuclease protein  27.83 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4771  AP endonuclease  25 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4680  AP endonuclease  25 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.110375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2423  xylose isomerase domain-containing protein  27.49 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0964314  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2177  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.19 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000702324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.81 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0137  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2882  xylose isomerase domain-containing protein  28.16 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0615  xylose isomerase domain-containing protein  26.72 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1856  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.9 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>