158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1079 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1719  hypothetical protein  56.55 
 
 		 293 aa  291  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6726  putative endonuclease protein  56.36 
 
 		 285 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.36 
 
 		 290 aa  281  8.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.834913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4007  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.81 
 
 		 269 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3367  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.36 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0137  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.14 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2459  xylose isomerase domain-containing protein  51.66 
 
 		 292 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0140499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2853  xylose isomerase domain-containing protein  51.29 
 
 		 274 aa  258  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2423  xylose isomerase domain-containing protein  51.84 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0964314  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1107  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.44 
 
 		 273 aa  244  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06440  sugar phosphate isomerase/epimerase  49.31 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2177  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.79 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000702324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  49.26 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3334  xylose isomerase domain-containing protein  48.13 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0606369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.69 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2281  hitchhiker  0.0000101278 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4011  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.69 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3593  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.3 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2882  xylose isomerase domain-containing protein  44.28 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  40.48 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.97 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362033  normal  0.0199285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04075  conserved hypothetical protein  39.63 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0808004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04037  hypothetical protein  39.63 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4453  AP endonuclease  39.63 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3803  xylose isomerase domain-containing protein  39.63 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465718  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0615  xylose isomerase domain-containing protein  43.06 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4771  AP endonuclease  39.63 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4680  AP endonuclease  39.63 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.110375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.96 
 
 		 286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40 
 
 		 296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.26 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  0.603305 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4176  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.97 
 
 		 394 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346853  hitchhiker  0.000695283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1856  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.84 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2394  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.99 
 
 		 316 aa  92  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4228  xylose isomerase domain-containing protein  30.97 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  29.43 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4709  myo-inositol catabolism protein  28.48 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0492702  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1876  xylose isomerase domain-containing protein  31.13 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1896  xylose isomerase-like TIM barrel  30.66 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1942  xylose isomerase domain-containing protein  30.66 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0606  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  29.72 
 
 		 624 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0633938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0418  xylose isomerase domain-containing protein  32.26 
 
 		 635 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  31.16 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2495  xylose isomerase domain-containing protein  30.86 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3597  xylose isomerase domain-containing protein  29.55 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.791675  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  23.79 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.58 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  30.86 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  28.74 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  25.41 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  29.45 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4496  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  31.35 
 
 		 638 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.86 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  30.25 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  29.07 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3362  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.86 
 
 		 635 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.789434 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  28.32 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  31.74 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  28.7 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2225  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.86 
 
 		 635 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2554  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.36 
 
 		 635 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00914053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3161  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.36 
 
 		 635 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.81 
 
 		 624 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  30.25 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5952  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  29.84 
 
 		 631 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0955687  decreased coverage  0.00791612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0292  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  31.72 
 
 		 615 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  27.66 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  29.46 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  29.93 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  29.46 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  27.27 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33680  hypothetical protein  31.9 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.91 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  31.48 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4572  hydroxypyruvate isomerase  28.74 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4905  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.8 
 
 		 633 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1560  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  29.51 
 
 		 632 aa  49.7  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.288895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  29.01 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4079  xylose isomerase domain-containing protein  30.43 
 
 		 629 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  26.95 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  27.78 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03000  hypothetical protein  28.95 
 
 		 634 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5095  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.82 
 
 		 604 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  30.54 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  25.75 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  30.54 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  30.54 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  27.98 
 
 		 515 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3911  xylose isomerase domain-containing protein  33.02 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0998183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3052  xylose isomerase domain-containing protein  25.9 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0431176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29270  sugar phosphate isomerase/epimerase  30.92 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  29.32 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4204  xylose isomerase domain-containing protein  30.58 
 
 		 629 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  31.43 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3418  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.67 
 
 		 630 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0242311  normal  0.14685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  26.39 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>