49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0115 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0115  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  583  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99603  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29270  sugar phosphate isomerase/epimerase  37.23 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2157  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.94 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  27.94 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4709  myo-inositol catabolism protein  25.54 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0492702  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3640  xylose isomerase domain-containing protein  30.69 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.91 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0110067  normal  0.529558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2459  xylose isomerase domain-containing protein  31.01 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0140499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6979  xylose isomerase domain-containing protein  28.4 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1508  xylose isomerase-like TIM barrel  27.78 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6321  xylose isomerase domain-containing protein  27.78 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3911  xylose isomerase domain-containing protein  29.51 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0998183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3702  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.52 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3564  xylose isomerase domain-containing protein  31.58 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0379741  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7181  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.55 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123498  normal  0.0907339 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3326  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.82 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  26.76 
 
 		 281 aa  49.3  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  29.32 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  29.32 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1099  xylose isomerase domain-containing protein  27.21 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1112  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.72 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.43 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  24.81 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0839  xylose isomerase domain-containing protein  23.79 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2853  xylose isomerase domain-containing protein  29.87 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2346  xylose isomerase domain-containing protein  30.99 
 
 		 276 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4011  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.08 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0418  xylose isomerase domain-containing protein  26.71 
 
 		 635 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.93 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2702  xylose isomerase domain-containing protein  29.71 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.964957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3362  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.21 
 
 		 635 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.789434 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1392  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.06 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2554  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.59 
 
 		 635 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00914053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3496  iolI protein  28.5 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3161  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.59 
 
 		 635 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  26.27 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0327  hypothetical protein  28.85 
 
 		 634 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.627098  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  26.27 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.39 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02058  hypothetical protein  31.07 
 
 		 626 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0224521  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0292  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.57 
 
 		 615 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2225  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.59 
 
 		 635 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6726  putative endonuclease protein  29.07 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3367  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.41 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33680  hypothetical protein  28.24 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4007  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.48 
 
 		 269 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0291  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.54 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.102645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2346  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  25.19 
 
 		 635 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>