103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2157 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2157  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 
280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0115  xylose isomerase domain-containing protein  33.94 
 
 
286 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99603  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29270  sugar phosphate isomerase/epimerase  36.59 
 
 
280 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0292  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.31 
 
 
615 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4305  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.51 
 
 
628 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.92924  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4415  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.51 
 
 
628 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  25.38 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3640  xylose isomerase domain-containing protein  29 
 
 
288 aa  58.9  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4709  myo-inositol catabolism protein  25.19 
 
 
277 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0492702  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0410  xylose isomerase-like TIM barrel  28.77 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2459  xylose isomerase domain-containing protein  26.82 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0140499  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  31.22 
 
 
285 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5035  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.12 
 
 
632 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02058  hypothetical protein  29.73 
 
 
626 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0224521  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3304  xylose isomerase domain-containing protein  28.92 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0184902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0418  xylose isomerase domain-containing protein  27.08 
 
 
635 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.51 
 
 
624 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33680  hypothetical protein  27.27 
 
 
274 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0882  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.85 
 
 
627 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3702  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.68 
 
 
313 aa  52.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 
286 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4079  xylose isomerase domain-containing protein  26.51 
 
 
629 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1894  putative amino acid dioxygenase  30.85 
 
 
684 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0327  hypothetical protein  33.67 
 
 
634 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.627098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3840  xylose isomerase domain-containing protein  31.19 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.479073 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0848  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.85 
 
 
684 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2191  sugar phosphate isomerases/epimerases  27.63 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2059  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  30.85 
 
 
687 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1752  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.85 
 
 
684 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10433  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2205  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.85 
 
 
684 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0577  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.85 
 
 
687 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0481  AP endonuclease  30.85 
 
 
684 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0891  AP endonuclease  30.85 
 
 
684 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.940921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  23.22 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3122  xylose isomerase domain-containing protein  32.46 
 
 
271 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03000  hypothetical protein  27.78 
 
 
634 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3692  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 
305 aa  49.3  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4567  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.72 
 
 
627 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4496  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  24.82 
 
 
638 aa  48.9  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2375  xylose isomerase-like TIM barrel  27.23 
 
 
477 aa  48.9  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38100  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  29.07 
 
 
632 aa  48.9  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.749235  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0782  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  24.77 
 
 
630 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.817905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2853  xylose isomerase domain-containing protein  27.54 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  28.26 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2346  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  30.23 
 
 
635 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2130  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28 
 
 
635 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0402618  normal  0.678263 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3326  xylose isomerase domain-containing protein  25.93 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4666  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.72 
 
 
630 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.735725 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5194  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.72 
 
 
630 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0122  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.23 
 
 
627 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.43 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2603  xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.58 
 
 
271 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0698398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1560  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  24.11 
 
 
632 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.288895  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3911  xylose isomerase domain-containing protein  28.85 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0998183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  25.18 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2149  xylose isomerase domain-containing protein  30.17 
 
 
271 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.398235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1081  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.19 
 
 
628 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796659  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3418  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.72 
 
 
630 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0242311  normal  0.14685 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7092  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.78 
 
 
631 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26168  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  22.69 
 
 
294 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0343  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.66 
 
 
630 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3062  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.37 
 
 
630 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5305  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.37 
 
 
630 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.114512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4963  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.37 
 
 
630 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3810  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.93 
 
 
280 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022666  normal  0.0930685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4755  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.91 
 
 
637 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304127  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3597  xylose isomerase domain-containing protein  29.69 
 
 
270 aa  45.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.791675  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4572  hydroxypyruvate isomerase  30.09 
 
 
258 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2699  xylose isomerase domain-containing protein  29.9 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.254699 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5952  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.5 
 
 
631 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0955687  decreased coverage  0.00791612 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5449  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.48 
 
 
615 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4090  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.47 
 
 
645 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.81 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0606  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.48 
 
 
624 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0633938 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5912  xylose isomerase domain-containing protein  29.58 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  decreased coverage  0.00155667 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2394  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.4 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515446  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4204  xylose isomerase domain-containing protein  26.61 
 
 
629 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460434  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3913  xylose isomerase domain-containing protein  27.18 
 
 
617 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.974395  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1477  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.83 
 
 
596 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3362  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.58 
 
 
635 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.789434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2225  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.2 
 
 
635 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44574  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2843  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2554  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.58 
 
 
635 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00914053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4905  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.91 
 
 
633 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0134  xylose isomerase domain-containing protein  25.18 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3161  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.58 
 
 
635 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706766  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4428  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.71 
 
 
633 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3240  xylose isomerase domain-containing protein  33.61 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308635  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1777  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.33 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6113  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  24.29 
 
 
623 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30200  Xylose isomerase-type TIM-barrel protein  24.34 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5789  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.33 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0619484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1508  xylose isomerase-like TIM barrel  28.07 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6321  xylose isomerase domain-containing protein  28.07 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4442  xylose isomerase domain-containing protein  26.18 
 
 
298 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.481875  normal  0.31172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5095  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.23 
 
 
604 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6979  xylose isomerase domain-containing protein  28.07 
 
 
295 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1854  xylose isomerase-like TIM barrel  23.13 
 
 
297 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.151277  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  24.63 
 
 
295 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>