55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1392 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1392  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 266 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1216  xylose isomerase domain-containing protein  38.89 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2699  xylose isomerase domain-containing protein  38.87 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.254699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2603  xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.24 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0698398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4909  xylose isomerase-like TIM barrel  41.53 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3240  xylose isomerase domain-containing protein  39.84 
 
 		 271 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3122  xylose isomerase domain-containing protein  39.43 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30200  Xylose isomerase-type TIM-barrel protein  40.74 
 
 		 271 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6104  xylose isomerase domain-containing protein  36.93 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2149  xylose isomerase domain-containing protein  38.62 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.398235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2702  xylose isomerase domain-containing protein  37.15 
 
 		 275 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.964957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2346  xylose isomerase domain-containing protein  47.12 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0783  xylose isomerase-like TIM barrel  42.32 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2191  sugar phosphate isomerases/epimerases  33.58 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.9 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2843  xylose isomerase domain-containing protein  40.23 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3810  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.1 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022666  normal  0.0930685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02960  hypothetical protein  40.74 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610778 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5912  xylose isomerase domain-containing protein  36.4 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  decreased coverage  0.00155667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1590  xylose isomerase-like TIM barrel  36.52 
 
 		 286 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2673  xylose isomerase domain-containing protein  34.57 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0410  xylose isomerase-like TIM barrel  31.95 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.78 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3481  xylose isomerase domain-containing protein  34.15 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3684  xylose isomerase domain-containing protein  33.05 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7150  xylose isomerase domain-containing protein  31.78 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3491  xylose isomerase domain-containing protein  30.3 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3640  xylose isomerase domain-containing protein  33.19 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0134  xylose isomerase domain-containing protein  31.22 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0839  xylose isomerase domain-containing protein  30.6 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1496  xylose isomerase domain-containing protein  27.89 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3304  xylose isomerase domain-containing protein  37.78 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4093  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.93 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.78661  normal  0.012574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0327  hypothetical protein  32.99 
 
 		 634 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.627098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2254  xylose isomerase domain-containing protein  29.96 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3326  xylose isomerase domain-containing protein  26.55 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4186  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.47 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4090  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 645 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03000  hypothetical protein  32.14 
 
 		 634 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135939 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6979  xylose isomerase domain-containing protein  32.52 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.39 
 
 		 624 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3911  xylose isomerase domain-containing protein  32.56 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0998183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6806  xylose isomerase domain-containing protein  29.91 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3597  xylose isomerase domain-containing protein  34.38 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.791675  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.63 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38100  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  29.55 
 
 		 632 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.749235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0292  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  31.15 
 
 		 615 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  25 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0115  xylose isomerase domain-containing protein  30.06 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99603  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4079  xylose isomerase domain-containing protein  27.39 
 
 		 629 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2346  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  29.31 
 
 		 635 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2225  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.93 
 
 		 635 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2130  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.68 
 
 		 635 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0402618  normal  0.678263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3362  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.45 
 
 		 635 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.789434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4905  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  29.9 
 
 		 633 aa  42  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>