64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2702 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2702  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.964957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1216  xylose isomerase domain-containing protein  54.55 
 
 		 270 aa  271  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2699  xylose isomerase domain-containing protein  55.6 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.254699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6104  xylose isomerase domain-containing protein  44.12 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30200  Xylose isomerase-type TIM-barrel protein  44.44 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4909  xylose isomerase-like TIM barrel  43.23 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2191  sugar phosphate isomerases/epimerases  39.85 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2149  xylose isomerase domain-containing protein  43.54 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.398235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2603  xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.48 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0698398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3122  xylose isomerase domain-containing protein  41.11 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3240  xylose isomerase domain-containing protein  43.03 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2673  xylose isomerase domain-containing protein  41.39 
 
 		 287 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.86 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02960  hypothetical protein  43.64 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610778 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1392  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.15 
 
 		 266 aa  142  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3481  xylose isomerase domain-containing protein  38.13 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5912  xylose isomerase domain-containing protein  40.8 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  decreased coverage  0.00155667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2346  xylose isomerase domain-containing protein  40.83 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2843  xylose isomerase domain-containing protein  38.91 
 
 		 269 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0410  xylose isomerase-like TIM barrel  34.08 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.6 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3810  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.44 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022666  normal  0.0930685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0783  xylose isomerase-like TIM barrel  35.15 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1590  xylose isomerase-like TIM barrel  33.7 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3491  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3684  xylose isomerase domain-containing protein  32.67 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414118  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3640  xylose isomerase domain-containing protein  38.36 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3304  xylose isomerase domain-containing protein  32.6 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7150  xylose isomerase domain-containing protein  30.38 
 
 		 299 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1496  xylose isomerase domain-containing protein  31.11 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6806  xylose isomerase domain-containing protein  30.7 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0134  xylose isomerase domain-containing protein  32.72 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0839  xylose isomerase domain-containing protein  32.89 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4093  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.93 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.78661  normal  0.012574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2254  xylose isomerase domain-containing protein  31.08 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3326  xylose isomerase domain-containing protein  30.3 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6979  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1508  xylose isomerase-like TIM barrel  28 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6321  xylose isomerase domain-containing protein  28 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1854  xylose isomerase-like TIM barrel  26.32 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.151277  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3911  xylose isomerase domain-containing protein  32.17 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0998183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0122  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 		 627 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4755  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  29.6 
 
 		 637 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3840  xylose isomerase domain-containing protein  31.93 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.479073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0882  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  29.81 
 
 		 627 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  28.57 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5952  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.6 
 
 		 631 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0955687  decreased coverage  0.00791612 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3692  xylose isomerase domain-containing protein  26.32 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2059  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  28.23 
 
 		 687 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1656  xylose isomerase domain-containing protein  23.68 
 
 		 297 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7092  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.83 
 
 		 631 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4567  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.03 
 
 		 627 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4428  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.19 
 
 		 633 aa  45.8  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0115  xylose isomerase domain-containing protein  29.71 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99603  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5194  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.58 
 
 		 630 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4666  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.58 
 
 		 630 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.735725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0782  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  29.59 
 
 		 630 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.817905  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4204  xylose isomerase domain-containing protein  26.43 
 
 		 629 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0327  hypothetical protein  27.81 
 
 		 634 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.627098  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4079  xylose isomerase domain-containing protein  25.17 
 
 		 629 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3418  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.13 
 
 		 630 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0242311  normal  0.14685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1477  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.17 
 
 		 596 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.82 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.17 
 
 		 624 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>