24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7181 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7181  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 270 aa  544  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123498  normal  0.0907339 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  89.26 
 
 		 270 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0110067  normal  0.529558 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4269  xylose isomerase domain-containing protein  66.29 
 
 		 271 aa  353  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3496  iolI protein  54.85 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3270  AP endonuclease  54.72 
 
 		 276 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2074  xylose isomerase-like TIM barrel  53.36 
 
 		 274 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2685  xylose isomerase domain-containing protein  53.36 
 
 		 274 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6013  xylose isomerase-like TIM barrel  53.38 
 
 		 275 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.920316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2738  xylose isomerase domain-containing protein  52.29 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413569  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0612  xylose isomerase domain-containing protein  54.14 
 
 		 275 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3284  xylose isomerase domain-containing protein  54.31 
 
 		 276 aa  268  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00754219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50090  myo-inositol catabolism protein  54.28 
 
 		 280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2714  xylose isomerase domain-containing protein  52.99 
 
 		 274 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.98 
 
 		 261 aa  262  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1677  xylose isomerase domain-containing protein  55.09 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2319  xylose isomerase domain-containing protein  52.24 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1245  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  46.97 
 
 		 273 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2926  xylose isomerase domain-containing protein  48.86 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369308  normal  0.384731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4717  xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.84 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4665  xylose isomerase domain-containing protein  34.5 
 
 		 278 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  27.11 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0115  xylose isomerase domain-containing protein  31.55 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99603  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  30.16 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4905  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.16 
 
 		 633 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>