24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2685 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2074  xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2685  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2714  xylose isomerase domain-containing protein  98.18 
 
 		 274 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6013  xylose isomerase-like TIM barrel  91.14 
 
 		 275 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.920316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2738  xylose isomerase domain-containing protein  89.3 
 
 		 276 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413569  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0612  xylose isomerase domain-containing protein  84.25 
 
 		 275 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3284  xylose isomerase domain-containing protein  60.45 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00754219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1245  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  59.48 
 
 		 273 aa  322  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3270  AP endonuclease  56.04 
 
 		 276 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3496  iolI protein  56.13 
 
 		 276 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2926  xylose isomerase domain-containing protein  57.78 
 
 		 273 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369308  normal  0.384731 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.99 
 
 		 270 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0110067  normal  0.529558 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4269  xylose isomerase domain-containing protein  53.23 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7181  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.36 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123498  normal  0.0907339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50090  myo-inositol catabolism protein  52.96 
 
 		 280 aa  262  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1677  xylose isomerase domain-containing protein  52.24 
 
 		 266 aa  241  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2319  xylose isomerase domain-containing protein  50.38 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.31 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4717  xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.19 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4665  xylose isomerase domain-containing protein  35.38 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  28.11 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4709  myo-inositol catabolism protein  26.97 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0492702  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.04 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1554  putative isomerase  29.48 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  0.610325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>