92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0409 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0409  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3955  xylose isomerase domain-containing protein  82.12 
 
 		 276 aa  434  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00177251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  35.89 
 
 		 699 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  35.08 
 
 		 699 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  24.73 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  31.97 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.21 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  29.02 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.5 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1934  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.46 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  22.05 
 
 		 266 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0542  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.63 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.74 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  34.34 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.16 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.9 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0292  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.2 
 
 		 615 aa  48.9  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.36 
 
 		 286 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  30.15 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01302  hypothetical protein  23.47 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.47 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01291  predicted enzyme  23.47 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1429  AP endonuclease  23.47 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1808  AP endonuclease  23.47 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.17 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  24.41 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.23 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  29.05 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2546  Hydroxypyruvate isomerase  35 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0308483  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1959  AP endonuclease, family 2  23.19 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0839995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3593  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.76 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1524  AP endonuclease  24.73 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  30.73 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2311  xylose isomerase domain-containing protein  23.47 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  29.31 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  29.17 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.59 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  29.11 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.16 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4784  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  33.33 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.871942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4665  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  33.33 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4655  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  33.33 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4805  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  33.33 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.296767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  35.11 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  32.73 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  27.31 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2225  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.75 
 
 		 635 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  37.65 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04064  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  31.46 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  28.57 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0393  xylose isomerase-like TIM barrel  23.83 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0897336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04026  hypothetical protein  31.46 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3796  hexulose-6-phosphate isomerase  31.46 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.542065  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.5 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2160  xylose isomerase domain-containing protein  25.57 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.26775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4758  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  31.46 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4668  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  31.11 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4328  xylose isomerase domain-containing protein  31.86 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4441  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  31.46 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5713  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  31.46 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.05 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  23.88 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0246  Hydroxypyruvate isomerase  38.1 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  28.24 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2544  xylose isomerase domain-containing protein  32.58 
 
 		 351 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3362  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.17 
 
 		 635 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.789434 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  26.4 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.03 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  27.48 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6979  xylose isomerase domain-containing protein  23.36 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  35.79 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  31.91 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.51 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.06 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4748  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  32.22 
 
 		 284 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5952  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.64 
 
 		 631 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0955687  decreased coverage  0.00791612 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7092  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25 
 
 		 631 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  35.79 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.56 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  25.43 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4727  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  30.34 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.04 
 
 		 350 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5169  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5480  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.71 
 
 		 272 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  0.229793 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  31.68 
 
 		 306 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5217  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.44 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.592377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.72 
 
 		 273 aa  42.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.63 
 
 		 274 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  27.48 
 
 		 308 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>