122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29590  sugar phosphate isomerase/epimerase  100 
 
 		 739 aa  1467    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2303  hypothetical protein  52.53 
 
 		 424 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0457  hypothetical protein  50.55 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.98 
 
 		 303 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.25 
 
 		 260 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2201  xylose isomerase domain-containing protein  38.19 
 
 		 258 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2228  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.04 
 
 		 287 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498591  normal  0.437814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1112  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.35 
 
 		 259 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2682  xylose isomerase domain-containing protein  37.19 
 
 		 258 aa  107  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1902  xylose isomerase domain-containing protein  30.96 
 
 		 299 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  34.11 
 
 		 278 aa  73.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2160  xylose isomerase domain-containing protein  31.67 
 
 		 262 aa  72.4  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.26775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01291  predicted enzyme  29.41 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.41 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1429  AP endonuclease  29.41 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.95 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2311  xylose isomerase domain-containing protein  29.41 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01302  hypothetical protein  29.41 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  32.65 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1808  AP endonuclease  29.41 
 
 		 262 aa  67  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.09 
 
 		 262 aa  66.6  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1959  AP endonuclease, family 2  29.41 
 
 		 262 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0839995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1524  AP endonuclease  28.57 
 
 		 262 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.97 
 
 		 283 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1528  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 264 aa  60.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  36.04 
 
 		 295 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  36.04 
 
 		 295 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1251  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.43 
 
 		 274 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725023  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  35.34 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.2 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4619  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.49 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154569  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  29.41 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.53 
 
 		 290 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08170  hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 276 aa  57  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.461944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0721  Hydroxypyruvate isomerase  30.28 
 
 		 265 aa  56.6  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.23 
 
 		 290 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  33.33 
 
 		 281 aa  55.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  25.9 
 
 		 295 aa  55.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 283 aa  55.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  25.17 
 
 		 264 aa  55.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4538  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.01 
 
 		 281 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.535239 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3635  xylose isomerase domain-containing protein  24.38 
 
 		 282 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  32.65 
 
 		 271 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  27.5 
 
 		 283 aa  53.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6726  putative endonuclease protein  26.55 
 
 		 285 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.39 
 
 		 289 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  29.14 
 
 		 250 aa  52.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  23.66 
 
 		 260 aa  51.6  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.88 
 
 		 282 aa  51.2  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0533  xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.74 
 
 		 282 aa  50.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.605213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.03 
 
 		 266 aa  50.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 		 285 aa  50.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  23.66 
 
 		 260 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  23.78 
 
 		 260 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3631  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.69 
 
 		 275 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.69 
 
 		 268 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  34.62 
 
 		 285 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.15 
 
 		 297 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  29.37 
 
 		 262 aa  48.9  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0015  hydroxypyruvate isomerase  25.19 
 
 		 258 aa  48.9  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  23.66 
 
 		 260 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  28.24 
 
 		 273 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0339  Hydroxypyruvate isomerase  26.72 
 
 		 267 aa  48.5  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12330  sugar phosphate isomerase/epimerase  30.58 
 
 		 288 aa  48.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205248  normal  0.361397 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  28.68 
 
 		 261 aa  47.8  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  28.68 
 
 		 261 aa  47.8  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  23.39 
 
 		 258 aa  47.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.89 
 
 		 275 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  25.64 
 
 		 276 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.64 
 
 		 276 aa  47  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  29.05 
 
 		 262 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  23.66 
 
 		 271 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  29.05 
 
 		 262 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  29.05 
 
 		 262 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  24.02 
 
 		 283 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  25.64 
 
 		 276 aa  47  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  23.84 
 
 		 266 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  22.16 
 
 		 258 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  22.16 
 
 		 258 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  24.2 
 
 		 258 aa  47.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.19 
 
 		 256 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4572  hydroxypyruvate isomerase  29.55 
 
 		 258 aa  47.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  25.64 
 
 		 276 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4007  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.56 
 
 		 269 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.69 
 
 		 292 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2059  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  28.96 
 
 		 687 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  22.78 
 
 		 265 aa  46.6  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  25.69 
 
 		 258 aa  46.6  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  24.3 
 
 		 297 aa  46.6  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4202  hydroxypyruvate isomerase  28.79 
 
 		 268 aa  46.6  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3407  hydroxypyruvate isomerase  28.65 
 
 		 269 aa  46.6  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  decreased coverage  0.0000181243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  25.64 
 
 		 276 aa  46.6  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  28.24 
 
 		 258 aa  46.6  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.94 
 
 		 273 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1969  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.59 
 
 		 270 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  29.79 
 
 		 256 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  25 
 
 		 276 aa  45.8  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3065  hypothetical protein  28.66 
 
 		 258 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765519  normal  0.510591 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>