241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08170 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08170  hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 276 aa  549  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.461944  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3689  xylose isomerase domain-containing protein  64.96 
 
 		 266 aa  333  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  66.54 
 
 		 266 aa  332  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0721  Hydroxypyruvate isomerase  60.55 
 
 		 265 aa  309  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0554  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.54 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  54.79 
 
 		 271 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0246  Hydroxypyruvate isomerase  58.56 
 
 		 277 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0339  Hydroxypyruvate isomerase  49.42 
 
 		 267 aa  261  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2546  Hydroxypyruvate isomerase  48.21 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0308483  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3558  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.46 
 
 		 269 aa  211  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4730  Hydroxypyruvate isomerase  45.49 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  40 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  35.41 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2851  hydroxypyruvate isomerase  40.36 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000102215  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  38.64 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  35.66 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  35.25 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  36.65 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  36.25 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  35.86 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  35.23 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  34.48 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  36.5 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  37.05 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  35.1 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  34.96 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  36.65 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  33.86 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  38.52 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  36.51 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  36.5 
 
 		 266 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  33.73 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  36.57 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  33.73 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  31.66 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  34.69 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  34.26 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  35.18 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  32.52 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  34.52 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  33.99 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4202  hydroxypyruvate isomerase  37.27 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  35.71 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  35.06 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  34.2 
 
 		 269 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  32.03 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 259 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  33.88 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  34.2 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  33.88 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  34.2 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  34.2 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  34.2 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  34.2 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  33.88 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  34.23 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  33.98 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  35.51 
 
 		 259 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  33.84 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0015  hydroxypyruvate isomerase  28.57 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  35.14 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  35.82 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4572  hydroxypyruvate isomerase  38.8 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  35.82 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  35.82 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  33.47 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  34.81 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  33.47 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  34.6 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  34.29 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  34.66 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  30.57 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  33.88 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  32.66 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  33.84 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  34.6 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  32.7 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3195  hydroxypyruvate isomerase  33.58 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568718  normal  0.0120723 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  31.73 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  33.46 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  33.84 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  33.84 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  30.83 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  33.84 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  32.11 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  28.69 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  34.09 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  27.78 
 
 		 258 aa  112  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  32.7 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  32.7 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  31.64 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  34.26 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3407  hydroxypyruvate isomerase  35.52 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  decreased coverage  0.0000181243 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  33.07 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  31.2 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  31.2 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  32.82 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  31.2 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>