68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1537 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2296  xylose isomerase domain-containing protein  86.12 
 
 		 284 aa  484  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  0.299582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.9 
 
 		 285 aa  254  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0501  xylose isomerase domain-containing protein  47.22 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4521  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  38.49 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1208  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.21 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  31.95 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.84 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.68 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.9 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  23.83 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2298  xylose isomerase-like TIM barrel  28.77 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  23.74 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.95 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.37 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28960  sugar phosphate isomerase/epimerase  37.01 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  26.17 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.38 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.55 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  26.67 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0133  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.92 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.64 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  26.47 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  31.29 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3174  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.03 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  28.12 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  22.01 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  25.83 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.45 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2872  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00133727  normal  0.0357921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.69 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.4 
 
 		 536 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  24.48 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1444  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.16 
 
 		 327 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3582  xylose isomerase domain-containing protein  27.94 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.744907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  25.61 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.4 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2628  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00560  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.69 
 
 		 309 aa  45.8  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.73 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  26.72 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.47 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.99 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28710  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.39 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0885144  normal  0.0589318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4958  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.88 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  24.81 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  21.37 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  27.48 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  27.48 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  25.78 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.47 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  21.37 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  27.48 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  27.48 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  26.06 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  22.55 
 
 		 843 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.5 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0433  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  21.37 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  21.26 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.76 
 
 		 262 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  24.64 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  23.88 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  22.39 
 
 		 298 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  29.84 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  25.95 
 
 		 313 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>