19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3582 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3582  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.744907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28960  sugar phosphate isomerase/epimerase  44.71 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2282  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1988  petrobactin biosynthesis protein AsbF  28.14 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4058  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.29 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3763  xylose isomerase domain-containing protein  30.29 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1849  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3341  petrobactin biosynthesis protein AsbF  26.95 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.935338  hitchhiker  0.0000000000000165736 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1817  hypothetical protein  27.06 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1843  hypothetical protein  27.06 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1986  hypothetical protein  27.06 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2021  petrobactin biosynthesis protein AsbF  27.06 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84806e-44 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1800  hypothetical protein  27.06 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.62 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  27.94 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3461  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.31 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2298  xylose isomerase-like TIM barrel  26.01 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.86 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72992  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2364  xylose isomerase domain-containing protein  21.57 
 
 		 294 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.807591  normal  0.185458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>