58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1849 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1849  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 
280 aa  586  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1988  petrobactin biosynthesis protein AsbF  88.93 
 
 
280 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1800  hypothetical protein  88.21 
 
 
280 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3341  petrobactin biosynthesis protein AsbF  87.86 
 
 
280 aa  525  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.935338  hitchhiker  0.0000000000000165736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1843  hypothetical protein  87.86 
 
 
280 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1817  hypothetical protein  87.86 
 
 
280 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1986  hypothetical protein  87.86 
 
 
280 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2021  petrobactin biosynthesis protein AsbF  87.86 
 
 
280 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84806e-44 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2628  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.8 
 
 
289 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2298  xylose isomerase-like TIM barrel  47.08 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4058  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.07 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3763  xylose isomerase domain-containing protein  42.7 
 
 
278 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.32 
 
 
278 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72992  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3527  xylose isomerase domain-containing protein  39.57 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28960  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.17 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.66 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  23.99 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3582  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.744907  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.35 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24.23 
 
 
828 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0499  xylose isomerase domain-containing protein  21.2 
 
 
282 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0204  xylose isomerase domain-containing protein  24.14 
 
 
322 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0210  xylose isomerase domain-containing protein  24.14 
 
 
322 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.71 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.12 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000375488  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  29.25 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.39 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  22.44 
 
 
843 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  21.01 
 
 
338 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2335  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.05 
 
 
271 aa  45.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  19.28 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.3 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.22 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  21.79 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  28.09 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  18.01 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  18.42 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.27 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  28.09 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4327  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.66 
 
 
337 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  26.97 
 
 
308 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.87 
 
 
277 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  22.07 
 
 
304 aa  42.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  28.09 
 
 
308 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  22.56 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4669  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.74 
 
 
284 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104946  hitchhiker  0.000000014237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  28.09 
 
 
308 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0057  xylose isomerase domain-containing protein  31.15 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  21.69 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.27 
 
 
332 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  20.16 
 
 
307 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 
282 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  21.33 
 
 
334 aa  42.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  25.96 
 
 
265 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  23.64 
 
 
313 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.53 
 
 
283 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  25.74 
 
 
258 aa  42  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>