47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4669 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4669  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 284 aa  587  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104946  hitchhiker  0.000000014237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3140  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.73 
 
 		 310 aa  286  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.5 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1842  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.83 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1232  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.09 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  hitchhiker  0.00338141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4312  sugar phosphate isomerases/epimerases  28.28 
 
 		 283 aa  92  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.517232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0458  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.11 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0286  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.77 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3328  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1896  xylose isomerase domain-containing protein  23.08 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  24.12 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  28.67 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  27.27 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2266  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.12 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00648615  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  26.21 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  24.69 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  28.87 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5480  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.5 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  0.229793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.19 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  29.36 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  23.53 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.16 
 
 		 308 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5217  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.32 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.592377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1938  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.5 
 
 		 256 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000239688  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  27.64 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  22.14 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  25 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  20.48 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  21.21 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  23.74 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  24.31 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  22.14 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  23.08 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1498  xylose isomerase domain-containing protein  21.48 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000176809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.52 
 
 		 480 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0386  xylose isomerase domain-containing protein  23.03 
 
 		 306 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1849  xylose isomerase domain-containing protein  21.74 
 
 		 280 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.89 
 
 		 828 aa  42.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  23.46 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.17 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  25.16 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  26.4 
 
 		 268 aa  42  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3341  petrobactin biosynthesis protein AsbF  23.3 
 
 		 280 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.935338  hitchhiker  0.0000000000000165736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.17 
 
 		 338 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>