127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1842 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1842  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 287 aa  591  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1232  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  70.71 
 
 		 279 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  hitchhiker  0.00338141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4312  sugar phosphate isomerases/epimerases  36.76 
 
 		 283 aa  161  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.517232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3140  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.46 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4669  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.15 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104946  hitchhiker  0.000000014237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.14 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  33.59 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  29.33 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  29.73 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  31.33 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2266  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.53 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00648615  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  30.38 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0458  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.63 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  31.01 
 
 		 644 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.15 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.94 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  30.53 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  30.53 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  30.53 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1717  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.62 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  28.24 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.01 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  26 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5480  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.71 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  0.229793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  29.77 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0395  xylose isomerase domain-containing protein  27.34 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0482433 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1498  xylose isomerase domain-containing protein  29.1 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000176809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  27.13 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1892  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0241791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  29.77 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  28.97 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  28.28 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.81 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1893  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  30 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  28.19 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  26.81 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.61 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  26.57 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4661  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.91 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  24.71 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  23.03 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0136  xylose isomerase domain-containing protein  20.91 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3491  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.99 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  33.33 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  33.33 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  33.33 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  33.33 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3337  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.97 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.679518 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5217  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.63 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.592377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.41 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  29.01 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.41 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0393  xylose isomerase-like TIM barrel  23.83 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0897336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  48.9  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.32 
 
 		 283 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000202898  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  29.57 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1781  xylose isomerase domain-containing protein  25.12 
 
 		 347 aa  48.9  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1682  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.89 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0286  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.23 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1543  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.34 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.482416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1695  sugar phosphate isomerases/epimerases  24.26 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6351  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.11 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  22.38 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  29.77 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8255  xylose isomerase domain-containing protein  23.01 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4380  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.59 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0301241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.69 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  29.17 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.49 
 
 		 339 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.48 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  33.71 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.11 
 
 		 305 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 318 aa  45.8  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.62 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.340783  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4567  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.19 
 
 		 317 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.181708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.41 
 
 		 300 aa  45.8  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  29.91 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4651  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  24.88 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  25.95 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  26.95 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  27.42 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1046  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.04 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.77 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6358  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.46 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1429  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000502947  normal  0.0400752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3328  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.65 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0986  xylose isomerase domain-containing protein  29.51 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  27.42 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4327  xylose isomerase domain-containing protein  21.72 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.543415 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4691  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.08 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0568  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.86 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  25.36 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0784  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.36 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11150  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.81 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.750375  normal  0.0940368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>