132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3491 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3491  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 281 aa  584  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.83 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000202898  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1429  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.27 
 
 		 284 aa  319  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000502947  normal  0.0400752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2705  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.61 
 
 		 287 aa  248  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.917825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3337  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.86 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.679518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6351  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.04 
 
 		 279 aa  231  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3285  xylose isomerase domain-containing protein  35.55 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.87 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.340783  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1938  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.53 
 
 		 256 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000239688  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00428  Twin-arginine translocation pathway signal  32.03 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5021  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.88 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0136  xylose isomerase domain-containing protein  31.45 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1695  sugar phosphate isomerases/epimerases  28.91 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1892  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.62 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5169  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.23 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2692  twin-arginine translocation pathway signal  28.17 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1075  xylose isomerase domain-containing protein  31.86 
 
 		 249 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1628  xylose isomerase domain-containing protein  31.53 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0395  xylose isomerase domain-containing protein  29.84 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0482433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2188  xylose isomerase domain-containing protein  30.92 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.58 
 
 		 241 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3167  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.37 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4611  xylose isomerase domain-containing protein  31.18 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1892  xylose isomerase domain-containing protein  26.88 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0241791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2333  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1893  xylose isomerase domain-containing protein  27.24 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3435  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.39 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11160  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.31 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0334  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.08 
 
 		 318 aa  99.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.212034  normal  0.78899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0527  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.07 
 
 		 289 aa  99  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1543  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.9 
 
 		 245 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.482416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.46 
 
 		 324 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  hitchhiker  0.00235403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1198  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.22 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0784  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.25 
 
 		 278 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0252  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.05 
 
 		 248 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0574  xylose isomerase domain-containing protein  32.11 
 
 		 254 aa  92.4  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.21 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1723  xylose isomerase domain-containing protein  26.01 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0425  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.15 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4661  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.21 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  26.38 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0365  xylose isomerase domain-containing protein  28.63 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4324  xylose isomerase domain-containing protein  25.38 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5339  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.17 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00377604  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22460  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.67 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.11 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1046  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.39 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1595  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.9 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3458  xylose isomerase domain-containing protein  23.33 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1158  xylose isomerase-like TIM barrel  25.69 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20260  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.67 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.239255  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2406  hypothetical protein  25.1 
 
 		 253 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4327  xylose isomerase domain-containing protein  24.3 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.543415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2093  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.51 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446343  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.51 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3722  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.06 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0190729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4404  xylose isomerase domain-containing protein  24.4 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0747  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0088  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.36 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2541  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.23 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3701  hypothetical protein  26.72 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1192  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.44 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0886  xylose isomerase domain-containing protein  27.65 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.490019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27510  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.23 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.38 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03870  xylose isomerase-like enzyme  25.51 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3498  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.37 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503466  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1739  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.97 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.125041  normal  0.800521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2336  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.91 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.791708  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.63 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  31.08 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.74 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1232  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.81 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  hitchhiker  0.00338141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2972  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.36 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  28.74 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  28.74 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  27.59 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  27.59 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.31 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  28.11 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  27.97 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  27.2 
 
 		 309 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  23.51 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  26.44 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  24.9 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  27.97 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  23.11 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  27.47 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1842  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.99 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  26.32 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  25.2 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.88 
 
 		 924 aa  48.9  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.86 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.843177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  26.4 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  29.08 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.46 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  26.69 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  24.53 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  28.67 
 
 		 297 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>