100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2156 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 
241 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0136  xylose isomerase domain-containing protein  44.81 
 
 
250 aa  197  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1938  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.03 
 
 
256 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000239688  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1075  xylose isomerase domain-containing protein  39.26 
 
 
249 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0395  xylose isomerase domain-containing protein  42.21 
 
 
252 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0482433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1892  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.74 
 
 
296 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.42 
 
 
286 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.340783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00428  Twin-arginine translocation pathway signal  37.22 
 
 
334 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2333  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.18 
 
 
255 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1192  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.55 
 
 
284 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1046  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.75 
 
 
287 aa  151  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5021  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.36 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5169  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.57 
 
 
294 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6351  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.81 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1695  sugar phosphate isomerases/epimerases  35.06 
 
 
285 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.77 
 
 
287 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2692  twin-arginine translocation pathway signal  34.98 
 
 
300 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.81 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2188  xylose isomerase domain-containing protein  30.89 
 
 
290 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1543  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.4 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.482416  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11160  sugar phosphate isomerase/epimerase  34.31 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1198  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.17 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0334  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.03 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.212034  normal  0.78899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3435  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.29 
 
 
289 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0574  xylose isomerase domain-containing protein  38.37 
 
 
254 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3285  xylose isomerase domain-containing protein  30.35 
 
 
287 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4327  xylose isomerase domain-containing protein  34.26 
 
 
249 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.543415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.71 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  hitchhiker  0.00235403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0365  xylose isomerase domain-containing protein  31.3 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4661  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.77 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0252  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.99 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.74 
 
 
292 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142923  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3491  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.58 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642855  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1893  xylose isomerase domain-containing protein  31.99 
 
 
304 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0559869  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1628  xylose isomerase domain-containing protein  29.58 
 
 
319 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1158  xylose isomerase-like TIM barrel  30.31 
 
 
253 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1892  xylose isomerase domain-containing protein  31.62 
 
 
304 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0241791  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3458  xylose isomerase domain-containing protein  35.68 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27510  sugar phosphate isomerase/epimerase  33.58 
 
 
274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31 
 
 
283 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000202898  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2705  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.17 
 
 
287 aa  111  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.917825  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0527  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.6 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820487  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0425  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0747  xylose isomerase domain-containing protein  31.4 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1723  xylose isomerase domain-containing protein  32.82 
 
 
253 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4404  xylose isomerase domain-containing protein  31.4 
 
 
250 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0784  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.88 
 
 
278 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03870  xylose isomerase-like enzyme  34.54 
 
 
244 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  32 
 
 
258 aa  105  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4611  xylose isomerase domain-containing protein  30.04 
 
 
325 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3337  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.72 
 
 
287 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.679518 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3167  twin-arginine translocation pathway signal  33.09 
 
 
326 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1595  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.74 
 
 
284 aa  101  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3498  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  35.12 
 
 
248 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503466  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5339  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.69 
 
 
250 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00377604  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2336  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.06 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.791708  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3722  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.23 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0190729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0886  xylose isomerase domain-containing protein  28.69 
 
 
254 aa  95.5  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.490019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20260  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.83 
 
 
293 aa  95.9  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.239255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2972  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.29 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4324  xylose isomerase domain-containing protein  30.83 
 
 
309 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1429  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.61 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000502947  normal  0.0400752 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3701  hypothetical protein  25.74 
 
 
259 aa  93.2  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.79 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0088  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.67 
 
 
341 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2406  hypothetical protein  30.74 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2093  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.46 
 
 
253 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446343  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2541  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.85 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.04 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.843177  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22460  sugar phosphate isomerase/epimerase  25 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1739  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.64 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.125041  normal  0.800521 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.65 
 
 
301 aa  58.9  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  25.22 
 
 
296 aa  52  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  32.19 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  24.78 
 
 
296 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  27.63 
 
 
297 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  34.51 
 
 
308 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  24.56 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  22.14 
 
 
298 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0986  xylose isomerase domain-containing protein  24 
 
 
273 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  36.17 
 
 
307 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  33.63 
 
 
308 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  33.63 
 
 
308 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.68 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  31.2 
 
 
307 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  24.56 
 
 
298 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  24.8 
 
 
302 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  25.14 
 
 
298 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  25.14 
 
 
298 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  24.56 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  25.2 
 
 
302 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.25 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.15 
 
 
294 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3839  xylose isomerase domain-containing protein  26.29 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  32.74 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.56 
 
 
308 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  28.49 
 
 
308 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  20.59 
 
 
297 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  32.74 
 
 
308 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  31.86 
 
 
308 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>